Molekulární rozpoznávání kolicinů U a Y svými imunitními proteiny.

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14110%2F05%3A00013197" target="_blank" >RIV/00216224:14110/05:00013197 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Molekulární rozpoznávání kolicinů U a Y svými imunitními proteiny.

Popis výsledku v původním jazyce

Koliciny jsou antibakteriální proteiny, jejichž geny jsou lokalizovány na plazmidech a jsou produkovány bakteriálními kmeny z čeledi Enterobacteriaceae (zejména druhem Escherichia coli). Toxický účinek (tvorba iontových kanálů v plazmatické membráně) jezajišťován C-koncovou doménou a je omezen na citlivé kmeny druhů stejných nebo příbuzných kmenu produkčnímu. Syntézou imunitního proteinu, jehož gen je součástí kolicinogenního plazmidu, se producenti brání letálnímu efektu syntetizovaného kolicinu. Interakce mezi rozpustným kolicinem a membránově vázaným imunitním proteinem je vhodným modelem pro studium protein-proteinových interakcí. Vybrali jsme si dvojici kolicinů U a Y, mezi nimiž je 87% totožnost na úrovni aminokyselinové sekvence a přesto jejichproducenti nejsou navzájem zkříženě imunní. Mutovali jsme aminokyseliny kolicinu U (Y) ve smyslu sekvence kolicinu Y (U), sledovali změny v interakci mutovaných kolicinů s imunitním proteinem a určili interakční aminokyseliny kolicinu U

Název v anglickém jazyce

Molecular recognition of colicin U and Y by their immunity proteins

Popis výsledku anglicky

Colicins are antibacterial toxins produced by strains of Escherichia coli and related bacteria that provide a selective advantage against closely related strains in the competition among bacteria. Toxic effect that is mediated by the C-terminal domain isdepolarization of the cytoplasmic membrane of sensitive cells. The plasmid encoded immunity protein ensures that producers are protected against the effect of their own colicin. The recognition of soluble colicin by the membrane-bounded immunity proteinis a suitable model for studying protein-protein interactions. The pair of colicins U and Y had 87% identity in their pore-forming domains but the corresponding producers were not cross-immune. The amino acids of colicin U (Y) were mutated into those appearing in the sequence of colicin Y (U) and changes in the interactions between mutated colicins and immunity proteins were monitored and interactions sites were identified.

Druh

O - Ostatní výsledky

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/GA310%2F03%2F1091" target="_blank" >GA310/03/1091: Mapování interakce kolicinů s citlivou a imunní bakteriální buňkou: receptorové studie a inaktivace kolicinu jeho imunitním proteinem</a><br>

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2005

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů