Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Whole Genome Sequence of the Treponema pallidum subsp. endemicum Strain Bosnia A: The Genome Is Related to Yaws Treponemes but Contains Few Loci Similar to Syphilis Treponemes

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14110%2F14%3A00074160" target="_blank" >RIV/00216224:14110/14:00074160 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1371/journal.pntd.0003261" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1371/journal.pntd.0003261</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1371/journal.pntd.0003261" target="_blank" >10.1371/journal.pntd.0003261</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Whole Genome Sequence of the Treponema pallidum subsp. endemicum Strain Bosnia A: The Genome Is Related to Yaws Treponemes but Contains Few Loci Similar to Syphilis Treponemes

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Background: T. pallidum subsp. endemicum (TEN) is the causative agent of bejel (also known as endemic syphilis). Clinical symptoms of syphilis and bejel are overlapping and the epidemiological context is important for correct diagnosis of both diseases.In contrast to syphilis, caused by T. pallidum subsp. pallidum (TPA), TEN infections are usually spread by direct contact or contaminated utensils rather than by sexual contact. Bejel is most often seen in western Africa and in the Middle East. The strain Bosnia A was isolated in 1950 in Bosnia, southern Europe. Methodology/Principal Findings: The complete genome of the Bosnia A strain was amplified and sequenced using the pooled segment genome sequencing (PSGS) method and a combination of three next-generation sequencing techniques (SOLiD, Roche 454, and Illumina). Using this approach, a total combined average genome coverage of 5136was achieved. The size of the Bosnia A genome was found to be 1,137,653 bp, i.e. 1.6?2.

  • Název v anglickém jazyce

    Whole Genome Sequence of the Treponema pallidum subsp. endemicum Strain Bosnia A: The Genome Is Related to Yaws Treponemes but Contains Few Loci Similar to Syphilis Treponemes

  • Popis výsledku anglicky

    Background: T. pallidum subsp. endemicum (TEN) is the causative agent of bejel (also known as endemic syphilis). Clinical symptoms of syphilis and bejel are overlapping and the epidemiological context is important for correct diagnosis of both diseases.In contrast to syphilis, caused by T. pallidum subsp. pallidum (TPA), TEN infections are usually spread by direct contact or contaminated utensils rather than by sexual contact. Bejel is most often seen in western Africa and in the Middle East. The strain Bosnia A was isolated in 1950 in Bosnia, southern Europe. Methodology/Principal Findings: The complete genome of the Bosnia A strain was amplified and sequenced using the pooled segment genome sequencing (PSGS) method and a combination of three next-generation sequencing techniques (SOLiD, Roche 454, and Illumina). Using this approach, a total combined average genome coverage of 5136was achieved. The size of the Bosnia A genome was found to be 1,137,653 bp, i.e. 1.6?2.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    EB - Genetika a molekulární biologie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2014

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    PLoS neglected tropical diseases

  • ISSN

    1935-2735

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    8

  • Číslo periodika v rámci svazku

    11

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    13

  • Strana od-do

    "e3261"

  • Kód UT WoS článku

    000345514000016

  • EID výsledku v databázi Scopus