Analysis of membrane proteome of Paracoccus denitrificans by two-dimensional electrophoresis

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F02%3A00006413" target="_blank" >RIV/00216224:14310/02:00006413 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Analysis of membrane proteome of Paracoccus denitrificans by two-dimensional electrophoresis

Popis výsledku v původním jazyce

In facultative anaerobic bacterium P. denitrificans, a broad range of substrates can serve as carbon sources and terminal electrone acceptors. Successfull adaptation of this bacterium to altered conditions depends on expression of metabolically active proteins. For example, nitrate induces expression of some denitrification enzymes. Many important redox proteins are membrane-associated. For comprehensive study on changes of proteins level in this bacterium, we have optimized a method using two-dimensional electrophoresis (2-DE). Our work represents the first analysis of P. denitrificans proteome using 2-DE. Membrane suspension of anaerobically grown cells of Paracoccus denitrificans was prepared by combination of enzymatic and osmotic lysis, centrifugation and ulgtracentrifugation. We have tested various detergents and procedures for membrane proteins presolubilization (e.g., SDS, CHAPS, dodecyl-â-D-maltoside with 6-aminocaproic acid). Sample buffer and IEF gel composition effects on 2

Název v anglickém jazyce

Analysis of membrane proteome of Paracoccus denitrificans by two-dimensional electrophoresis

Popis výsledku anglicky

In facultative anaerobic bacterium P. denitrificans, a broad range of substrates can serve as carbon sources and terminal electrone acceptors. Successfull adaptation of this bacterium to altered conditions depends on expression of metabolically active proteins. For example, nitrate induces expression of some denitrification enzymes. Many important redox proteins are membrane-associated. For comprehensive study on changes of proteins level in this bacterium, we have optimized a method using two-dimensional electrophoresis (2-DE). Our work represents the first analysis of P. denitrificans proteome using 2-DE. Membrane suspension of anaerobically grown cells of Paracoccus denitrificans was prepared by combination of enzymatic and osmotic lysis, centrifugation and ulgtracentrifugation. We have tested various detergents and procedures for membrane proteins presolubilization (e.g., SDS, CHAPS, dodecyl-â-D-maltoside with 6-aminocaproic acid). Sample buffer and IEF gel composition effects on 2

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

CE - Biochemie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/GA203%2F01%2F1589" target="_blank" >GA203/01/1589: Mechanizmy regulace respiračních systémů denitrifikačních bakterií faktory prostředí</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2002

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

XVIII. biochemický zjazd. Zborník.

ISBN

—

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

1

Strana od-do

160

Název nakladatele

Slovenská spoločnosť pre biochémiu a molekulárnu biológiu pri SAV

Místo vydání

Stará Lesná

Místo konání akce

Vysoké Tatry, Stará Lesná 10.-13.9.2002

Datum konání akce

1. 1. 2002

Typ akce podle státní příslušnosti

EUR - Evropská akce

Kód UT WoS článku

—