Analýza proteomu bakterie Paracoccus denitrificans

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F03%3A00007947" target="_blank" >RIV/00216224:14310/03:00007947 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Analýza proteomu bakterie Paracoccus denitrificans

Popis výsledku v původním jazyce

Gramnegativní bakterie Paracoccus denitrificans se vyznačuje značnou adaptovatelností na růstové podmínky: je schopna existence za podmínek aerobních či anaerobních, přičemž jako terminální akceptory může sloužit mnoho substrátů: kromě kyslíku také NO3-,NO2- či plynný N2O. Změna v expresi proteinů při přechodu z aerobních podmínek na anaerobní zřejmě souvisí s regulačními proteiny citlivými k azidu. Pro sledování všech těchto změn expresního profilu se jeví jako velice perspektivní soubor proteomickýchmetod. Pro komplexní analýzu proteinového složení P. denitrificans byla nově zavedena metodika vysokorozlišovací dvourozměrné elektroforézy (2-DE) s imobilizovanými pH gradienty v prvním rozměru, a to jak v analytickém, tak i mikropreparativním uspořádání. Pro analýzu celobuněčného proteomu jsme vyvinuli postup přípravy vzorků a optimalizovali protokol pro jejich analýzu dvourozměrnou elektroforézou. Tento protokol může být použit např. pro srovnání změn expresního profilu vyvolaných rů

Název v anglickém jazyce

Analysis of proteome of bacterium Paracoccus denitrificans

Popis výsledku anglicky

Gramnegative bacterium Paracoccus denitrificans is able to grow under broad variety of conditions. Adaptation to altered conditions strongly depends on changes in expression of metabolically active proteins. For study on changes of protein levels in whole-cell extract as well as in bacterial membrane of Paracoccus denitrificans, we have developed methods based on two-dimensional electrophoresis with immobilised pH gradients. Optimization of critical points of both protocols is demonstrated. We have compared effect of anaerobiosis on protein composition of bacterial membrane using optimized method. Several proteins on protein maps were sucessfully identified using MALDI-TOF mass spectrometry.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

CE - Biochemie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/GA203%2F01%2F1589" target="_blank" >GA203/01/1589: Mechanizmy regulace respiračních systémů denitrifikačních bakterií faktory prostředí</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2003

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

VII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků

ISBN

80-210-3053-4

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

2

Strana od-do

17

Název nakladatele

Přírodovědecká fakulta Masarykovy univerzity v Brně

Místo vydání

Brno

Místo konání akce

29.1.2003 Brno

Datum konání akce

1. 1. 2003

Typ akce podle státní příslušnosti

CST - Celostátní akce

Kód UT WoS článku

—