Vliv kultivačních podmínek na proteinové složení membránové frakce Paracoccus denitrificans

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F02%3A00019686" target="_blank" >RIV/00216224:14310/02:00019686 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

The effect of cultivation conditions on protein composition of Paracoccus denitrificans membrane

Popis výsledku v původním jazyce

New method using two-dimensional gel electrophoresis was optimised for Paracoccus denitrificans cell envelope study. This approach consist of sample preparation especially optimised for Paracoccus denitrificans membrane proteins, carrier-ampholyte isoelectric focusation in the first dimension (CA-IEF) and sodium dodecyl sulphate polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) in the second dimension. Acquired 2-D gels were compared using image analysis and PDQUEST software. Various conditions of initial solubilisation using various detergents were tested. Sodium dodecyl sulphate (SDS), 3-[(3-cholamidopropyl)dimethylammonio]-1-propanesulfo-nate (CHAPS), dodecyl-â-D-maltoside and 6-aminocaproic acid were used for this purpose. Sample buffer and IEF gel composition effects on 2-D gels resolution were also tested. Extraction using free detergent was compared with extraction using diluted detergent in mixture with sample buffer. Dilution ratio between presolubilised extract and sample buffer

Název v anglickém jazyce

The effect of cultivation conditions on protein composition of Paracoccus denitrificans membrane

Popis výsledku anglicky

New method using two-dimensional gel electrophoresis was optimised for Paracoccus denitrificans cell envelope study. This approach consist of sample preparation especially optimised for Paracoccus denitrificans membrane proteins, carrier-ampholyte isoelectric focusation in the first dimension (CA-IEF) and sodium dodecyl sulphate polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) in the second dimension. Acquired 2-D gels were compared using image analysis and PDQUEST software. Various conditions of initial solubilisation using various detergents were tested. Sodium dodecyl sulphate (SDS), 3-[(3-cholamidopropyl)dimethylammonio]-1-propanesulfo-nate (CHAPS), dodecyl-â-D-maltoside and 6-aminocaproic acid were used for this purpose. Sample buffer and IEF gel composition effects on 2-D gels resolution were also tested. Extraction using free detergent was compared with extraction using diluted detergent in mixture with sample buffer. Dilution ratio between presolubilised extract and sample buffer

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

CE - Biochemie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/GA203%2F01%2F1589" target="_blank" >GA203/01/1589: Mechanizmy regulace respiračních systémů denitrifikačních bakterií faktory prostředí</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2002

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

VI. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků.

ISBN

80-210-2777-0

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

1

Strana od-do

67

Název nakladatele

Masarykova univerzita

Místo vydání

Brno

Místo konání akce

7.2.2002 Brno

Datum konání akce

1. 1. 2002

Typ akce podle státní příslušnosti

CST - Celostátní akce

Kód UT WoS článku

—