ANALÝZA POLYMORFISMU DNA MARKERŮ U PŘÍRODNÍCH POZDNĚ KVETOUCÍCH LINIÍ ARABIDOPSIS THALIANA

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F03%3A00008645" target="_blank" >RIV/00216224:14310/03:00008645 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/00216224:14310/03:00009857

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

ANALÝZA POLYMORFISMU DNA MARKERŮ U PŘÍRODNÍCH POZDNĚ KVETOUCÍCH LINIÍ ARABIDOPSIS THALIANA

Popis výsledku v původním jazyce

Cílem této práce bylo určit polymorfismus u vybraných DNA markerů mezi pěti přírodními pozdně kvetoucími liniemi z jižní Moravy (Je-4, Je-18, Je-27, Je-28 a Hod) a devíti laboratorními liniemi (Col, Ler, S96, Di-G, H55, En-2, La-O, Nd-O a Ws) Arabidopsisthaliana. Výsledky budou využity pro křížení vhodných linií za účelem mapování genů způsobujících pozdnost v přírodních populacích. Určení mapové pozice genu spočívá ve stanovení četnosti rekombinace sledovaného znaku s markerem. V naší laboratoři k těmto účelům využíváme tzv. DNA markerů založených na PCR, především SSLP (simple sequence length polymorphisms) markery. Jedná se o repetitivní sekvence, jejichž počet opakování se liší u různých genotypů. Při vazbové analýze je vždy křížena rostlina s mapovaným znakem s rostlinou standardního genotypu, přičemž oba genotypy musí být v SSLP markeru vzájemně polymorfní. Polymorfismus byl sledován u třinácti mikrosatelitních markerů, které rovnoměrně pokrývají celý genom A. thaliana - nga 280

Název v anglickém jazyce

THE ANALYSIS OF DNA POLYMORPHISM IN NATURAL LATE FLOWERING GENOTYPES OF ARABIDOPSIS THALIANA

Popis výsledku anglicky

The main objective of this work was to determine the polymorphism of DNA markers among five natural late-flowering ecotypes from southern Moravia (Je-4, Je-18, Je-27, Je-28 a Hod) and nine laboratory lines (Col, Ler, S96, Di-G, H55, En-2, La-O, Nd-O a Ws) in Arabidopsis thaliana. The results will be used for crossing of the suitable lines in the process of mapping the genes of late flowering in the natural populations of A. thaliana For determining the map position of a gene we use DNA markers based onPCR, above all SSLP (simple sequence length polymorphisms) markers. They are composed of tandemly repeated short DNA sequences, usually polymorphic in different ecotypes. For mapping, the late-flowering plant is crossed with the plant of standard genotype, whereas both genotypes must be polymorphic in SSLP marker together. The polymorphisms have been analysed in thirteen microsatellite markers that are spread in the whole genome of A. thaliana - nga 280, ATPASE, nga 1145, nga 168, nga 16

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

—

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2003

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

VII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů

ISBN

80-210-3053-4

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

2

Strana od-do

42-43

Název nakladatele

Masarykova univerzita v Brně

Místo vydání

Brno

Místo konání akce

Brno

Datum konání akce

29. 1. 2003

Typ akce podle státní příslušnosti

CST - Celostátní akce

Kód UT WoS článku

—