Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Ribozomalny Kink-turn motiv - flexibilny molekularny klb

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F04%3A00021349" target="_blank" >RIV/00216224:14310/04:00021349 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

  • DOI - Digital Object Identifier

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Ribosomal RNA Kink-turn motif - a flexible molecular hinge

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Ribosomal RNA K-turn motifs are asymmetric internal loops characterized by a sharp bend in the phosphodiester backbone resulting in &quot;V&quot; shaped structures, recurrently observed in ribosomes and showing high degree of sequence conservation. We have carried out extended explicit solvent molecular dynamics simulations of selected K-turns, in order to investigate their intrinsic structural and dynamical properties. The simulations reveal an unprecedented dynamical flexibility of the K-turns aroundtheir x-ray geometries. The K-turns sample, on the nanosecond timescale, different conformational substates. The overall behaviour of the simulations suggests that the sampled geometries are essentially isoenergetic and separated by minimal energy barriers. The nanosecond dynamics of isolated K-turns can be qualitatively considered as motion of two rigid helix stems controlled by a very flexible internal loop which then leads to substantial hinge-like motions between the two stems. This

  • Název v anglickém jazyce

    Ribosomal RNA Kink-turn motif - a flexible molecular hinge

  • Popis výsledku anglicky

    Ribosomal RNA K-turn motifs are asymmetric internal loops characterized by a sharp bend in the phosphodiester backbone resulting in &quot;V&quot; shaped structures, recurrently observed in ribosomes and showing high degree of sequence conservation. We have carried out extended explicit solvent molecular dynamics simulations of selected K-turns, in order to investigate their intrinsic structural and dynamical properties. The simulations reveal an unprecedented dynamical flexibility of the K-turns aroundtheir x-ray geometries. The K-turns sample, on the nanosecond timescale, different conformational substates. The overall behaviour of the simulations suggests that the sampled geometries are essentially isoenergetic and separated by minimal energy barriers. The nanosecond dynamics of isolated K-turns can be qualitatively considered as motion of two rigid helix stems controlled by a very flexible internal loop which then leads to substantial hinge-like motions between the two stems. This

Klasifikace

  • Druh

    D - Stať ve sborníku

  • CEP obor

    CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/LN00A016" target="_blank" >LN00A016: BIOMOLEKULÁRNÍ CENTRUM</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2004

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název statě ve sborníku

    Conference on Current Trends in Computational Chemistry

  • ISBN

  • ISSN

  • e-ISSN

  • Počet stran výsledku

    1

  • Strana od-do

    87-87

  • Název nakladatele

    Jackson, Miss, USA

  • Místo vydání

    Jackson, MS, USA

  • Místo konání akce

    Jackson, MS, USA

  • Datum konání akce

    1. 1. 2004

  • Typ akce podle státní příslušnosti

    WRD - Celosvětová akce

  • Kód UT WoS článku