Evoluce a transdruhový polymorfizmus MHC genů třídy IIB u kaprovitých ryb
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F05%3A00012368" target="_blank" >RIV/00216224:14310/05:00012368 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Evolution and trans-species polymorphism of MHC class IIB genes in cyprinid fish
Popis výsledku v původním jazyce
The polymorphism of DAB genes encoding MHC IIb was investigated in 11 cyprinid species from central Europe.The species belonged to four subfamilies: Cyprininae, Tincinae, Gobioninae and Leuciscinae. Two paralogous groups of sequences, DAB1 and DAB3, wererecognised according to the similarity of their nucleotide and amino-acid sequences and from phylogenetic analyses using either partial exon 2 or partial exon 3 sequences. A high allelic variability among species was found for exon 2, indicating extensive MHC polymorphism. Time divergence estimation supports the separation of DAB1 and DAB3 groups predating the separation into fish subfamilies, and a cyprinid origin of the DAB genes. Phylogenetic trees using exon 2 support the hypothesis of trans-species polymorphism, which appears to be limited to the subfamily level, i.e. the presence of sequences from different species in the same allelic group was more often recognised within subfamilies Cyprininae and Leuciscinae than between them.
Název v anglickém jazyce
Evolution and trans-species polymorphism of MHC class IIB genes in cyprinid fish
Popis výsledku anglicky
The polymorphism of DAB genes encoding MHC IIb was investigated in 11 cyprinid species from central Europe.The species belonged to four subfamilies: Cyprininae, Tincinae, Gobioninae and Leuciscinae. Two paralogous groups of sequences, DAB1 and DAB3, wererecognised according to the similarity of their nucleotide and amino-acid sequences and from phylogenetic analyses using either partial exon 2 or partial exon 3 sequences. A high allelic variability among species was found for exon 2, indicating extensive MHC polymorphism. Time divergence estimation supports the separation of DAB1 and DAB3 groups predating the separation into fish subfamilies, and a cyprinid origin of the DAB genes. Phylogenetic trees using exon 2 support the hypothesis of trans-species polymorphism, which appears to be limited to the subfamily level, i.e. the presence of sequences from different species in the same allelic group was more often recognised within subfamilies Cyprininae and Leuciscinae than between them.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/GA524%2F04%2F1128" target="_blank" >GA524/04/1128: MHC třída IIB genů evropských kaprovitých ryb: jejich genetická variabilita a evoluce ve vztahu k životní strategii hostitelů a parazitismu</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2005
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Fish and Shellfish Immunology
ISSN
1050-4648
e-ISSN
—
Svazek periodika
18
Číslo periodika v rámci svazku
3
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
24
Strana od-do
199-222
Kód UT WoS článku
—
EID výsledku v databázi Scopus
—