Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Evoluce a transdruhový polymorfizmus MHC genů třídy IIB u kaprovitých ryb

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F05%3A00012368" target="_blank" >RIV/00216224:14310/05:00012368 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

  • DOI - Digital Object Identifier

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Evolution and trans-species polymorphism of MHC class IIB genes in cyprinid fish

  • Popis výsledku v původním jazyce

    The polymorphism of DAB genes encoding MHC IIb was investigated in 11 cyprinid species from central Europe.The species belonged to four subfamilies: Cyprininae, Tincinae, Gobioninae and Leuciscinae. Two paralogous groups of sequences, DAB1 and DAB3, wererecognised according to the similarity of their nucleotide and amino-acid sequences and from phylogenetic analyses using either partial exon 2 or partial exon 3 sequences. A high allelic variability among species was found for exon 2, indicating extensive MHC polymorphism. Time divergence estimation supports the separation of DAB1 and DAB3 groups predating the separation into fish subfamilies, and a cyprinid origin of the DAB genes. Phylogenetic trees using exon 2 support the hypothesis of trans-species polymorphism, which appears to be limited to the subfamily level, i.e. the presence of sequences from different species in the same allelic group was more often recognised within subfamilies Cyprininae and Leuciscinae than between them.

  • Název v anglickém jazyce

    Evolution and trans-species polymorphism of MHC class IIB genes in cyprinid fish

  • Popis výsledku anglicky

    The polymorphism of DAB genes encoding MHC IIb was investigated in 11 cyprinid species from central Europe.The species belonged to four subfamilies: Cyprininae, Tincinae, Gobioninae and Leuciscinae. Two paralogous groups of sequences, DAB1 and DAB3, wererecognised according to the similarity of their nucleotide and amino-acid sequences and from phylogenetic analyses using either partial exon 2 or partial exon 3 sequences. A high allelic variability among species was found for exon 2, indicating extensive MHC polymorphism. Time divergence estimation supports the separation of DAB1 and DAB3 groups predating the separation into fish subfamilies, and a cyprinid origin of the DAB genes. Phylogenetic trees using exon 2 support the hypothesis of trans-species polymorphism, which appears to be limited to the subfamily level, i.e. the presence of sequences from different species in the same allelic group was more often recognised within subfamilies Cyprininae and Leuciscinae than between them.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    EB - Genetika a molekulární biologie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/GA524%2F04%2F1128" target="_blank" >GA524/04/1128: MHC třída IIB genů evropských kaprovitých ryb: jejich genetická variabilita a evoluce ve vztahu k životní strategii hostitelů a parazitismu</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2005

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Fish and Shellfish Immunology

  • ISSN

    1050-4648

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    18

  • Číslo periodika v rámci svazku

    3

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    24

  • Strana od-do

    199-222

  • Kód UT WoS článku

  • EID výsledku v databázi Scopus