Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Structure, diversity and evolutionary patterns of expressed MHC class IIB genes in chub (Squalius cephalus), a cyprinid fish species from Europe

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F11%3A00049665" target="_blank" >RIV/00216224:14310/11:00049665 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1007/s00251-010-0495-3" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1007/s00251-010-0495-3</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1007/s00251-010-0495-3" target="_blank" >10.1007/s00251-010-0495-3</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Structure, diversity and evolutionary patterns of expressed MHC class IIB genes in chub (Squalius cephalus), a cyprinid fish species from Europe

  • Popis výsledku v původním jazyce

    The polymorphism of exon 2 of the DAB genes (MHC class IIB) was investigated in the freshwater cyprinid fish species, Squalius cephalus in the wide range of its distribution in Europe. We identified 111 different DAB variants in 15 chub populations. Thesequence analysis showed that many structurally important amino acid sites that were conserved among tetrapods were also conserved in chub. The analysis of recombination indicated that it does not play an important role in producing and maintaining the variation of DAB genes analyzed in the present study. The exon 2 was shown to be subjected to intense positive selection. Phylogenetic analysis and sequence identities suggest the presence of two class IIB loci in chub. A contrasting selection pattern wasfound in DAB1-like and DAB3-like genes, which suggests the potential functional differences between these genes.

  • Název v anglickém jazyce

    Structure, diversity and evolutionary patterns of expressed MHC class IIB genes in chub (Squalius cephalus), a cyprinid fish species from Europe

  • Popis výsledku anglicky

    The polymorphism of exon 2 of the DAB genes (MHC class IIB) was investigated in the freshwater cyprinid fish species, Squalius cephalus in the wide range of its distribution in Europe. We identified 111 different DAB variants in 15 chub populations. Thesequence analysis showed that many structurally important amino acid sites that were conserved among tetrapods were also conserved in chub. The analysis of recombination indicated that it does not play an important role in producing and maintaining the variation of DAB genes analyzed in the present study. The exon 2 was shown to be subjected to intense positive selection. Phylogenetic analysis and sequence identities suggest the presence of two class IIB loci in chub. A contrasting selection pattern wasfound in DAB1-like and DAB3-like genes, which suggests the potential functional differences between these genes.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    EC - Imunologie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2011

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Immunogenetics

  • ISSN

    0093-7711

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    63

  • Číslo periodika v rámci svazku

    3

  • Stát vydavatele periodika

    CZ - Česká republika

  • Počet stran výsledku

    15

  • Strana od-do

    167-181

  • Kód UT WoS článku

    000287148700004

  • EID výsledku v databázi Scopus