Charakterizace proteomu bakteriofága 812

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F05%3A00012894" target="_blank" >RIV/00216224:14310/05:00012894 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Charakterizace proteomu bakteriofága 812

Popis výsledku v původním jazyce

Lytický bakteriofág 812 patří mezi slibné kandidáty na terapii stafylokokových infekcí jako náhrada léčby antibiotiky. Proteom bakteriofága 812 byl analyzován vybranými technikami hmotnostní spektrometrie a separace. Bylo identifikováno jedenáct proteinůz toho sedm poprvé. Gelová elektroforéza s peptidovým mapováním byla shledána nejúčinnější technikou pro celkovou analýzu; HPLC-ESI MS byla použita pro potvrzení ve sporných případech. Zdánlivě anomální migrace hlavního proteinu bičíkové pochvy (812_mtsp) byla vysvětlena po separaci gelovou elektroforézou za upravených podmínek a peptidovým mapováním pomocí MALDI TOF a TOF/TOF MS. Tři fragmenty proteinu 812_mtsp o podobné velikosti, které původně migrovaly v jedné zóně, byly odděleny a identifikovány.Charakterizace proteomu bakteriofága 812 je předpokladem pro budoucí srovnání standardního fága 812 s jeho mutanty a příbuznými fágy a korelaci změn proteomu se změnami rozmezí hostitele.

Název v anglickém jazyce

Charakterization of bacteriphage 812 proteome

Popis výsledku anglicky

A lytic bacteriophage 812 ranks among to promising candidates for phage therapy, which emerges as an alternative to antibiotics for treatment of staphylococcal infections. Proteome of bacteriophage 812 was analyzed using various mass spectrometry techniques. Eleven proteins were identified, of which seven proteins were identified for the first time. Gel electrophoresis with peptide mass fingerprinting was found the most efficient for overall analysis; HPLC-ESI MS was used for confirmation in dubious cases. Seemingly abnormal migration of main tail sheath protein (812_mtsp) was explained after adjustment of gel electrophoresis conditions and peptide mass fingerprinting combined with MALDI TOF/TOF MS results. Three similarly-sized 812_mtsp fragments, which originally migrated in one band, were separated and identified. Proteome characterization of bacteriophage 812 is a prerequisite for future comparison of the standard-type phage 812 with its mutants and related phages to correlate prot

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

CB - Analytická chemie, separace

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/GA203%2F03%2F0515" target="_blank" >GA203/03/0515: Integrovaná analýza genomu a proteomu terapeuticky významných bakteriofágů kombinací elektroforézy a hmotnostní spektrometrie</a><br>

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2005

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Chemické listy

ISSN

0009-2770

e-ISSN

—

Svazek periodika

99

Číslo periodika v rámci svazku

12

Stát vydavatele periodika

CZ - Česká republika

Počet stran výsledku

5

Strana od-do

962-966

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—