Rozdílný mechanismus CDK5 a CDK2 activace. Dynamika komplexů CDK5/p25 a CDK2/Cyklin A

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F06%3A00015728" target="_blank" >RIV/00216224:14310/06:00015728 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/61989592:15310/06:00004795

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

DIFFERENT MECHANISMS OF CDK5 AND CDK2 ACTIVATION AS REVEALED BY CDK5/P25 AND CDK2/CYCLIN A DYNAMICS

Popis výsledku v původním jazyce

A detailed analysis is presented of the dynamics of human CDK5 in complexes with the protein activator p25 and the purine-like inhibitor roscovitine. These, and other findings related to the activation of CDK5 are critically reviewed from a molecular perspective. In addition, the results obtained on the behavior of CDK5 are compared to data on CDK2 to assess the differences and similarities between the two kinases in terms of (i) roscovitine binding, (ii) regulatory subunit association, (iii) conformational changes in the T-loop following CDK/regulatory subunit complex formation and (iv) specificity in CDK/regulatory subunit recognition. An energy decomposition analysis, used for these purposes, revealed why the binding of p25 alone is sufficient to stabilize the extended active T-loop conformation of CDK5, whereas the equivalent conformational change in CDK2 requires both the binding of Cyclin A and phosphorylation of the Thr160 residue. The interaction energy of the CDK5 T-loop with

Název v anglickém jazyce

DIFFERENT MECHANISMS OF CDK5 AND CDK2 ACTIVATION AS REVEALED BY CDK5/P25 AND CDK2/CYCLIN A DYNAMICS

Popis výsledku anglicky

A detailed analysis is presented of the dynamics of human CDK5 in complexes with the protein activator p25 and the purine-like inhibitor roscovitine. These, and other findings related to the activation of CDK5 are critically reviewed from a molecular perspective. In addition, the results obtained on the behavior of CDK5 are compared to data on CDK2 to assess the differences and similarities between the two kinases in terms of (i) roscovitine binding, (ii) regulatory subunit association, (iii) conformational changes in the T-loop following CDK/regulatory subunit complex formation and (iv) specificity in CDK/regulatory subunit recognition. An energy decomposition analysis, used for these purposes, revealed why the binding of p25 alone is sufficient to stabilize the extended active T-loop conformation of CDK5, whereas the equivalent conformational change in CDK2 requires both the binding of Cyclin A and phosphorylation of the Thr160 residue. The interaction energy of the CDK5 T-loop with

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2006

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

The Journal of biological chemistry

ISSN

0021-9258

e-ISSN

—

Svazek periodika

281

Číslo periodika v rámci svazku

11

Stát vydavatele periodika

CZ - Česká republika

Počet stran výsledku

11

Strana od-do

7271-7281

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—