Použití metod SSCP a TGGE pro screening kandidátních genů LQTS
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F06%3A00016651" target="_blank" >RIV/00216224:14310/06:00016651 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
Použití metod SSCP a TGGE pro screening kandidátních genů LQTS
Popis výsledku v původním jazyce
Bylo navrženo 47 párů primerů, které pokrývají kódující oblast genu SCN5A a KCND3. Proběhla optimalizace podmínek PCR a SSCP pro všechny analyzované fragmenty. Byla úspešně optimalizována TGGE pro všechny fragmenty genu KCND3 a exon 2 a 28-3 genu SCN5A.Mutační analýza genu SCN5A byla provedena u 65 pacientů, genu KCND3 u 25 pacientů s podezřením na LQTS. Žádná mutace, která by přímo zapříčiňovala LQTS nebyla nalezena. V našem souboru pacientů byly nalezeny jednonukleotidové polymorfizmy v pozici 5457 (exon 28) a 87 (exon 2) od počátku kódující sekvence genu SCN5A. Oba polymorfizmy jsou synonymní.
Název v anglickém jazyce
Usage of SSCP and TGGE for Screening of LQTS Candidate Genes
Popis výsledku anglicky
Fourty seven pairs of the primers which cover the coding region of the genes SCN5A and KCND3 were designed. We optimized the conditions of PCR and SSCP for all analyzed fragments and TGGE for all the fragments of the gene KCND3 and the exon 2 and 28-3 ofgene SCN5A. We screened the gene SCN5A of 65 patients, the gene KCND3 of 25 patients suspicious of LQTS. No mutation leading to LQTS was found. We found two SNPs in our file of patients at the position 5457 (exon 28) and 87 (exon 2) from the beginning of coding sequence of the gene SCN5A. Both SNPs are synonymous.
Klasifikace
Druh
D - Stať ve sborníku
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2006
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název statě ve sborníku
X. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů
ISBN
80-210-3942-6
ISSN
—
e-ISSN
—
Počet stran výsledku
1
Strana od-do
88-89
Název nakladatele
Masarykova univerzita
Místo vydání
Brno
Místo konání akce
Brno
Datum konání akce
1. 1. 2006
Typ akce podle státní příslušnosti
WRD - Celosvětová akce
Kód UT WoS článku
—