Využití MALDI-MS celobuněčných profilů při charakterizaci bakterií rodu Aeromonas

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F07%3A00022166" target="_blank" >RIV/00216224:14310/07:00022166 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Využití MALDI-MS celobuněčných profilů při charakterizaci bakterií rodu Aeromonas

Popis výsledku v původním jazyce

Rod Aeromonas působí jako podmíněný patogen člověka, teplokrevných a hlavně studenokrevných živočichů. Je častým izolátem z humánního a veterinárního klinického materiálu. Taxonomie rodu se vyvíjí; dle současného systému klasifikace patří do čeledi Aeromonadaceae řádu Aeromonadales3. Rod vykazuje vysokou heterogenitu a genetickou proměnlivost, fenotypová diferenciace je obtížná. Validně bylo doposud popsáno 17 druhů aeromonád řazených do pěti skupin1. Metoda matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight2 hmotnostní spektrometrie je analytická technika identifikující markery bakteriálního proteomu. Je vhodná pro rychlou identifikaci spekter MALDI MS profilu, charakteristického v rámci rodu, druhu a kmene. Cílem práce byla optimalizace kultivace, přípravy vzorku a podmínek pro hmotnostní analýzu, následné stanovení MALDI-MS profilu rodu, vyhledání druhově a rodově specifických markerů a jejich využití k taxonomické diferenciaci.

Název v anglickém jazyce

The application of MALDI MS whole-cell profiles of the genus Aeromonas

Popis výsledku anglicky

The genus Aeromonas is one of the medically important genera. Strains of this genus are often isolated from human and veterinary clinical material. The evolving taxonomy of the genus is in great progress. According to the contemporary system of classification genus belongs to the family Aeromonadacae and the order Aeromonadales3. The genus is typical by great heterogeneity and genetic variability; phenotypic differentiation is difficult. There were validly described 17 species of the genus Aeromonas classified into five groups1. Matrix assisted laser desorption/ionization time of flight2 mass spectrometry is an analytical technic, which identifies markers of the bacterial proteome. It is suitable for a rapid identification of spectral outcomes using MALDI MS profiles of the genus. Specific markers of genus and species are used for taxonomic differentiation. There were acquired typical mass spectra of protein and peptide markers by analysis of whole cells samples.

Druh

O - Ostatní výsledky

CEP obor

EE - Mikrobiologie, virologie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/LC06034" target="_blank" >LC06034: Regulace morfogeneze rostlinných buněk a orgánů</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2007

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů