Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Studying the binding properties of BclA lectin - experiment and modeling

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F08%3A00024972" target="_blank" >RIV/00216224:14310/08:00024972 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

  • DOI - Digital Object Identifier

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Studying the binding properties of BclA lectin - experiment and modeling

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Burkholderia cenocepacia is a ubiquitous bacterium that can act as opportunistic human pathogen, responsible for lethal complications in cystic fibrosis patients. The genome of the bacterium contains several lectin- like sequences that are related to previously characterized fucose-preferring lectin PAIIL from Pseudomonas aeruginosa . BclA is a lectin from B.cenocepacia that shares the unique sugar binding mode common to PAIIL family lectins. Molecular docking was performed using the AUTODOCK and DOCK software. The AMBER package was used for molecular dynamics simulations. Enzyme linked lectin assay, surface plasmon resonance and isothermal titration calorimetry was used to determine the binding properties experimentally.Experiments determined that BclA prefers mannose to fucose as the binding partner. Despite the sequence similarity, BclA adopts dimeric form, as opposed to tetrameric PAIIL, possible consequence of the presence of an extra loop. Docking experiments combined with molecu

  • Název v anglickém jazyce

    Studying the binding properties of BclA lectin - experiment and modeling

  • Popis výsledku anglicky

    Burkholderia cenocepacia is a ubiquitous bacterium that can act as opportunistic human pathogen, responsible for lethal complications in cystic fibrosis patients. The genome of the bacterium contains several lectin- like sequences that are related to previously characterized fucose-preferring lectin PAIIL from Pseudomonas aeruginosa . BclA is a lectin from B.cenocepacia that shares the unique sugar binding mode common to PAIIL family lectins. Molecular docking was performed using the AUTODOCK and DOCK software. The AMBER package was used for molecular dynamics simulations. Enzyme linked lectin assay, surface plasmon resonance and isothermal titration calorimetry was used to determine the binding properties experimentally.Experiments determined that BclA prefers mannose to fucose as the binding partner. Despite the sequence similarity, BclA adopts dimeric form, as opposed to tetrameric PAIIL, possible consequence of the presence of an extra loop. Docking experiments combined with molecu

Klasifikace

  • Druh

    D - Stať ve sborníku

  • CEP obor

    CE - Biochemie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/GA303%2F06%2F0570" target="_blank" >GA303/06/0570: Strukturně-funkční studie lektinů a adhezinů patogenních mikroorganismů</a><br>

  • Návaznosti

    Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2008

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název statě ve sborníku

    FEBS Journal

  • ISBN

  • ISSN

    1742-464X

  • e-ISSN

  • Počet stran výsledku

    1

  • Strana od-do

  • Název nakladatele

    BLACKWELL PUBLISHING

  • Místo vydání

    OXFORD

  • Místo konání akce

    Athens

  • Datum konání akce

    1. 1. 2008

  • Typ akce podle státní příslušnosti

    WRD - Celosvětová akce

  • Kód UT WoS článku

    000256633300472