In silico mutagenesis and docking study of RSL lectin
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F10%3A00043733" target="_blank" >RIV/00216224:14310/10:00043733 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
In silico mutagenesis and docking study of RSL lectin
Popis výsledku v původním jazyce
The gram-negative bacterium Ralstonia solanacearum produces a potent L-fucose binding lectin (RSL). This work is focused on in silico mutagenesis, docking of fucose and fucosylated oligosaccharides in RSL lectin. Binding energy pattern of various saccharides was investigated by a series of docking simulations. Docking experiments were performed using the software AutoDock 3, AutoDock Vina, DOCK v.6.2 and ICM Dock. Performance of various docking programs will be discussed with respect to binding energy of those saccharides measured from SPR experiment.
Název v anglickém jazyce
In silico mutagenesis and docking study of RSL lectin
Popis výsledku anglicky
The gram-negative bacterium Ralstonia solanacearum produces a potent L-fucose binding lectin (RSL). This work is focused on in silico mutagenesis, docking of fucose and fucosylated oligosaccharides in RSL lectin. Binding energy pattern of various saccharides was investigated by a series of docking simulations. Docking experiments were performed using the software AutoDock 3, AutoDock Vina, DOCK v.6.2 and ICM Dock. Performance of various docking programs will be discussed with respect to binding energy of those saccharides measured from SPR experiment.
Klasifikace
Druh
O - Ostatní výsledky
CEP obor
BO - Biofyzika
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach
Ostatní
Rok uplatnění
2010
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů