Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Exploring the 3D structure of the N-acetylglucosaminyltransferase V

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F09%3A00039160" target="_blank" >RIV/00216224:14310/09:00039160 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

  • DOI - Digital Object Identifier

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Exploring the 3D structure of the N-acetylglucosaminyltransferase V

  • Popis výsledku v původním jazyce

    In the present study, we have attempted to build model of the GnT-V 3D-structure. Unfortunately, it is not clear to which GT family GnT-V belongs, therefore, we used one structure from the GT-A family and one structure from the GT-B one as structure templates. Selected structures had the best primary sequence alignment with GnT-V minimal catalytic domain. We have chosen structure of Core2 transferase (2GAM) as the representative of the GT-A family and MurG transferase (1NLM) as the representative of theGT-B family, respectively. We made several alignments employing different algorithms, namely with Blosum62, 120PAM or 3D-PSSM. We obtain altogether 10 models of the GnT-V structure.

  • Název v anglickém jazyce

    Exploring the 3D structure of the N-acetylglucosaminyltransferase V

  • Popis výsledku anglicky

    In the present study, we have attempted to build model of the GnT-V 3D-structure. Unfortunately, it is not clear to which GT family GnT-V belongs, therefore, we used one structure from the GT-A family and one structure from the GT-B one as structure templates. Selected structures had the best primary sequence alignment with GnT-V minimal catalytic domain. We have chosen structure of Core2 transferase (2GAM) as the representative of the GT-A family and MurG transferase (1NLM) as the representative of theGT-B family, respectively. We made several alignments employing different algorithms, namely with Blosum62, 120PAM or 3D-PSSM. We obtain altogether 10 models of the GnT-V structure.

Klasifikace

  • Druh

    O - Ostatní výsledky

  • CEP obor

    CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

  • Návaznosti

    S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2009

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů