Metodologie stanovení variability alel MHC genů u ryb čeledi Cyprinidae

Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F11%3A00050361" target="_blank" >RIV/00216224:14310/11:00050361 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—

Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
Metodologie stanovení variability alel MHC genů u ryb čeledi Cyprinidae
Popis výsledku v původním jazyce
K analýze variability exprimovaných genů DAB1 a DAB3 u kaprovitých ryb jsme použili 2 metody. První metoda zahrnuje SSCP analýzu, klonování PCR amplikonů, a automatické sekvenování. Jako druhou jsme optimalizovali přípravu vzorků pro ?klonální? sekvenování druhé generace (NGS ? next generation sequencing) s využitím technologie 454 pyrosekvenování. V příspěvku srovnáváme klady a zápory námi používaných metod testování.
Název v anglickém jazyce
The methodology of variability determination in MHC genes in fish of family Cyprinidae
Popis výsledku anglicky
To analyze the variability of expressed DAB1 and DAB3 genes in cyprinid fish we used two methods. The first one includes SSCP analysis, cloning of PCR amplicons and automatic sequencing. As the second one we optimized the preparation of the samples for clonal next generation sequencing (NGS) with usage of technology of 454 pyrosequencing. In the present work we compare pros and cones of the described methods used for testing.

Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění
2011
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Podobné výsledky(10)