Efficiency of PCR-based methods in discriminating Bifidobacterium longum ssp. longum and Bifidobacterium longum ssp. infantis strains of human origin

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F11%3A00053293" target="_blank" >RIV/00216224:14310/11:00053293 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/61388971:_____/11:00370661

Výsledek na webu

<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.mimet.2011.06.014" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1016/j.mimet.2011.06.014</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.mimet.2011.06.014" target="_blank" >10.1016/j.mimet.2011.06.014</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Efficiency of PCR-based methods in discriminating Bifidobacterium longum ssp. longum and Bifidobacterium longum ssp. infantis strains of human origin

Popis výsledku v původním jazyce

Four molecular-biological methods (PCRs, random amplified polymorphic DNA (RAPD) method using 5 primers, repetitive sequence-based (rep)-PCR with BOXA1R and (GTG)5 primers and amplified ribosomal DNA restriction analysis (ARDRA)) and biochemical analysiswere compared for the classification of B. longum strains isolated from the faeces of breast-fed healthy infants (25), healthy adults (3) and 2 collection strains. These methods together with arabionose/ melezitose fermentation analysis clearly differentiated only the collection strains into B. longum ssp. longum and B. longum ssp. infantis at the subspecies level. On the other hand, ARDRA analysis differentiated the strains into the B. longum/infantis subspecies using the cleavage analysis of genus-specific amplicon with just one enzyme, Sau3AI. Moreover, we propose a classification of the collection strains into the subspecies level: B. longum CCM 3764 as B. longum ssp. longum CCM 3764, B. longum ATCC 17930 as B. longum ssp. infantis

Název v anglickém jazyce

Efficiency of PCR-based methods in discriminating Bifidobacterium longum ssp. longum and Bifidobacterium longum ssp. infantis strains of human origin

Popis výsledku anglicky

Four molecular-biological methods (PCRs, random amplified polymorphic DNA (RAPD) method using 5 primers, repetitive sequence-based (rep)-PCR with BOXA1R and (GTG)5 primers and amplified ribosomal DNA restriction analysis (ARDRA)) and biochemical analysiswere compared for the classification of B. longum strains isolated from the faeces of breast-fed healthy infants (25), healthy adults (3) and 2 collection strains. These methods together with arabionose/ melezitose fermentation analysis clearly differentiated only the collection strains into B. longum ssp. longum and B. longum ssp. infantis at the subspecies level. On the other hand, ARDRA analysis differentiated the strains into the B. longum/infantis subspecies using the cleavage analysis of genus-specific amplicon with just one enzyme, Sau3AI. Moreover, we propose a classification of the collection strains into the subspecies level: B. longum CCM 3764 as B. longum ssp. longum CCM 3764, B. longum ATCC 17930 as B. longum ssp. infantis

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/2B06053" target="_blank" >2B06053: Nové postupy při charakterizaci a identifikaci probiotických kmenů bakterií vhodných pro funkční potraviny.</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2011

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Journal of Microbiological Methods

ISSN

0167-7012

e-ISSN

—

Svazek periodika

87

Číslo periodika v rámci svazku

1

Stát vydavatele periodika

NL - Nizozemsko

Počet stran výsledku

7

Strana od-do

10-16

Kód UT WoS článku

000296946400002

EID výsledku v databázi Scopus

—