Evidence for Centromere Drive in the Holocentric Chromosomes of Caenorhabditis
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F12%3A00057248" target="_blank" >RIV/00216224:14310/12:00057248 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0030496" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0030496</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0030496" target="_blank" >10.1371/journal.pone.0030496</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Evidence for Centromere Drive in the Holocentric Chromosomes of Caenorhabditis
Popis výsledku v původním jazyce
In monocentric organisms with asymmetric meiosis, the kinetochore proteins, such as CENH3 and CENP-C, evolve adaptively to counterbalance the deleterious effects of centromere drive, which is caused by the expansion of centromeric satellite repeats. Theselection regimes that act on CENH3 and CENP-C genes have not been analyzed in organisms with holocentric chromosomes, although holocentrism is speculated to have evolved to suppress centromere drive. We tested both CENH3 and CENP-C for positive selection in several species of the holocentric genus Caenorhabditis using the maximum likelihood approach and sliding-window analysis. Although CENP-C did not show any signs of positive selection, positive selection has been detected in the case of CENH3. Theseresults support the hypothesis that centromere drive occurs in Nematoda, at least in the telokinetic meiosis of Caenorhabditis.
Název v anglickém jazyce
Evidence for Centromere Drive in the Holocentric Chromosomes of Caenorhabditis
Popis výsledku anglicky
In monocentric organisms with asymmetric meiosis, the kinetochore proteins, such as CENH3 and CENP-C, evolve adaptively to counterbalance the deleterious effects of centromere drive, which is caused by the expansion of centromeric satellite repeats. Theselection regimes that act on CENH3 and CENP-C genes have not been analyzed in organisms with holocentric chromosomes, although holocentrism is speculated to have evolved to suppress centromere drive. We tested both CENH3 and CENP-C for positive selection in several species of the holocentric genus Caenorhabditis using the maximum likelihood approach and sliding-window analysis. Although CENP-C did not show any signs of positive selection, positive selection has been detected in the case of CENH3. Theseresults support the hypothesis that centromere drive occurs in Nematoda, at least in the telokinetic meiosis of Caenorhabditis.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2012
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
PloS ONE
ISSN
1932-6203
e-ISSN
—
Svazek periodika
7
Číslo periodika v rámci svazku
1
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
5
Strana od-do
1-5
Kód UT WoS článku
000301570600047
EID výsledku v databázi Scopus
—