Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Exploring the Nature of Carbohydrate-Aromatic Dispersion Interactions via Sophisticated Computational Chemistry Tools

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F12%3A00058656" target="_blank" >RIV/00216224:14310/12:00058656 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

  • DOI - Digital Object Identifier

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Exploring the Nature of Carbohydrate-Aromatic Dispersion Interactions via Sophisticated Computational Chemistry Tools

  • Popis výsledku v původním jazyce

    There are several ways how saccharides interact with proteins. The role of dispersion-driven CH-pi interactions in protein-carbohydrate interactions has been underestimated for a long time. This type of interaction occurs between carbohydrate apolar faces and aromatic amino-acid residues. We introduce first systematic study of CH-pi interactions between selected carbohydrates and aromatic amino-acid models: benzene and naphtalene. 3D interaction energy (Eint) scan was performed to elucidate interactionenergy maps for carbohydrate-benzene interaction. Resulting most stable complexes were reoptimized and their Eint were refined at highly-sophisticated level. To study possible degree of additivity, we used geometries of carbohydrate-benzene complexes tobuild-up monodentate (interaction with one CH-group) and bidentate (interaction with two CH-groups) carbohydrate-naphtalene complexes. Also these complexes underwent the optimization and energy refinement procedure as described.

  • Název v anglickém jazyce

    Exploring the Nature of Carbohydrate-Aromatic Dispersion Interactions via Sophisticated Computational Chemistry Tools

  • Popis výsledku anglicky

    There are several ways how saccharides interact with proteins. The role of dispersion-driven CH-pi interactions in protein-carbohydrate interactions has been underestimated for a long time. This type of interaction occurs between carbohydrate apolar faces and aromatic amino-acid residues. We introduce first systematic study of CH-pi interactions between selected carbohydrates and aromatic amino-acid models: benzene and naphtalene. 3D interaction energy (Eint) scan was performed to elucidate interactionenergy maps for carbohydrate-benzene interaction. Resulting most stable complexes were reoptimized and their Eint were refined at highly-sophisticated level. To study possible degree of additivity, we used geometries of carbohydrate-benzene complexes tobuild-up monodentate (interaction with one CH-group) and bidentate (interaction with two CH-groups) carbohydrate-naphtalene complexes. Also these complexes underwent the optimization and energy refinement procedure as described.

Klasifikace

  • Druh

    O - Ostatní výsledky

  • CEP obor

    CE - Biochemie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/GD301%2F09%2FH004" target="_blank" >GD301/09/H004: Molekulární a strukturní biologie vybraných cytostatik. Od mechanistických studií k chemoterapii rakoviny</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2012

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů