Srovnávací analýza repetitivních sekvencí Trifolium pratense a Trifolium medium sekvenováním nové generace

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F14%3A00073261" target="_blank" >RIV/00216224:14310/14:00073261 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://www.biologicals.cz/conferences/index.php?conference_id=20" target="_blank" >http://www.biologicals.cz/conferences/index.php?conference_id=20</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Srovnávací analýza repetitivních sekvencí Trifolium pratense a Trifolium medium sekvenováním nové generace

Popis výsledku v původním jazyce

Rod Trifolium (jetel) je jedním z agronomicky důležitých rodů čeledi Fabaceae. V České republice patří mezi nejvýznamnější zástupce jetel luční (T. pratense L.), který je kvalitní pícninou poskytující vysoké výnosy. Pro překonání nízké vytrvalosti byla vnedávné době provedena úspěšná mezidruhová hybridizace tetraploidního jetele lučního odrůdy Tatra (2n = 4x = 28) s planým oktoploidním jetelem prostředním (T. medium L.; 2n = 8x = 64). U obou druhů bylo provedeno sekvenování metodou Illumina a bioinformatická analýza získaných sekvencí s cílem charakterizovat repetitivní elementy. Druhová specifita byla potvrzena celkem u 2 elementů jetele lučního a 20 elementů jetele prostředního. Uvedené repetitivní elementy byly také lokalizovány na chromozomy příslušného druhu pomocí fluorescenční in situ hybridizace (FISH).

Název v anglickém jazyce

Comparative analysis of Trifolium pratense and Trifolium medium repetitive elements by next-generation sequencing

Popis výsledku anglicky

Red clover (T. pratense L.) is one of the most important forage crops in the Czech Republic. For improvement of its low persistence a succesful interspecific hybridization of tetraploid variety Tatra (2n = 4x = 28) and a wild octoploid zigzag clover (T.medium L.; 2x = 8n = 64) was performed. Both species were sequenced using Illumina platform and a bioinformatic analysis of repetitive elements was conducted. A total of 2 and 20 species-specific repetitive elements were validates and localized on chromozomes of red clover and zigzad clover by fluorescent in situ hybridization (FISH).

Druh

O - Ostatní výsledky

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/QI111A019" target="_blank" >QI111A019: Nové genomické postupy pro šlechtění cizosprašných plodin na zlepšení užitkových vlastností</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Rok uplatnění

2014

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů