Vývoj genově specifických DNA markerů pro skríning rostlin ve šlechtění jetele lučního

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F16%3A00087684" target="_blank" >RIV/00216224:14310/16:00087684 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/26296080:_____/16:N0000131

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Vývoj genově specifických DNA markerů pro skríning rostlin ve šlechtění jetele lučního

Popis výsledku v původním jazyce

Jetel luční (Trifolium pratense) je celosvětově důležitá pícnina. Cílem práce byla identifikace SSR (simple sequence repeat) markerů v kódujících sekvencích pro celý genom. Charakterizovali jsme 4005 potenciálních markerů s produkty amplifikace 100 až 350 bp. Hustota markerů byla jeden SSR na 12,39 kbp. Celkem 95 SSR v kódujících sekvencích bylo validováno pro 50 českých i zahraničních odrůd jetele lučního a byla získána kolekce 22 vysoce polymorfních markerů s PIC (polymorphism information content) &gt; 0.9. Tyto makery jsou vhodné pro studium diverzity u T. pratense a pro celogenomové studie vyhledávání markerů ve specifických genech využitelných ve šlechtění jetele lučního. Informace o příbuzenských vztazích u šlechtitelského materiálu jsou využitelné pro plánování křížení, ale i ochranu práv šlechtitelů prostřednictvím identifikace odrůd.

Název v anglickém jazyce

Development of gene specific DNA markers for plant screening in red clover breeding

Popis výsledku anglicky

Red clover (Trifolium pratense) is an important forage plant worldwide. We characterized 4,005 potential simple sequence repeat (SSR) markers generating polymerase chain reaction products preferentially within 100 to 350 bp. Marker density of 1 SSR marker per 12.39 kbp was achieved. Altogether, 95 SSRs in coding sequences were analysed for 50 red clover varieties and a collection of 22 highly polymorphic SSRs with PIC (polymorphism information content) &gt; 0.9 was generated, thus obtaining primer pairs for application to diversity studies in T. pratense. Predicted large sets of SSRs throughout the genome are key to rapidly implementing genome-based breeding approaches. Detailed knowledge of genetic relationships among breeding materials can also be useful for breeders in planning crosses or for plant variety protection.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/QI111A019" target="_blank" >QI111A019: Nové genomické postupy pro šlechtění cizosprašných plodin na zlepšení užitkových vlastností</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2016

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Úroda

ISSN

0139-6013

e-ISSN

—

Svazek periodika

2016

Číslo periodika v rámci svazku

12

Stát vydavatele periodika

CZ - Česká republika

Počet stran výsledku

4

Strana od-do

181-184

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—