Lone-pair–pi interactions: analysis of the physical origin and biolological implications
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F16%3A00087988" target="_blank" >RIV/00216224:14310/16:00087988 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1039/C6CP01524G" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1039/C6CP01524G</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1039/C6CP01524G" target="_blank" >10.1039/C6CP01524G</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Lone-pair–pi interactions: analysis of the physical origin and biolological implications
Popis výsledku v původním jazyce
Lone-pair-pi (lp-pi) interactions have been suggested to stabilize DNA and protein structures, and to participate in the formation of DNA-protein complexes. To elucidate their physical origin, we have carried out a theoretical multi-approach analysis of two biologically relevant model systems, the water-indole and water-uracil complexes, which we compared with the structurally similar chloride-tetracyanobenzene (TCB) complex previously shown to contain a strong charge-transfer (CT) binding component. We demonstrate that the CT component in lp-pi interactions between water and indole/uracil is significantly smaller than that stabilizing the Cl-TCB reference system. The strong lp(Cl-)-pi(TCB)* orbital interaction is characterized by a small energy gap and an efficient lp-pi* overlap. In contrast, in lp-pi interactions between water and indole or uracil, the corresponding energy gap is larger and the overlap less efficient.
Název v anglickém jazyce
Lone-pair–pi interactions: analysis of the physical origin and biolological implications
Popis výsledku anglicky
Lone-pair-pi (lp-pi) interactions have been suggested to stabilize DNA and protein structures, and to participate in the formation of DNA-protein complexes. To elucidate their physical origin, we have carried out a theoretical multi-approach analysis of two biologically relevant model systems, the water-indole and water-uracil complexes, which we compared with the structurally similar chloride-tetracyanobenzene (TCB) complex previously shown to contain a strong charge-transfer (CT) binding component. We demonstrate that the CT component in lp-pi interactions between water and indole/uracil is significantly smaller than that stabilizing the Cl-TCB reference system. The strong lp(Cl-)-pi(TCB)* orbital interaction is characterized by a small energy gap and an efficient lp-pi* overlap. In contrast, in lp-pi interactions between water and indole or uracil, the corresponding energy gap is larger and the overlap less efficient.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2016
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Physical Chemistry Chemical Physics
ISSN
1463-9076
e-ISSN
—
Svazek periodika
18
Číslo periodika v rámci svazku
28
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
10
Strana od-do
19472-19481
Kód UT WoS článku
000379939100089
EID výsledku v databázi Scopus
—