Izolace virových částic ze vzorků vod

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F16%3A00099972" target="_blank" >RIV/00216224:14310/16:00099972 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Izolace virových částic ze vzorků vod

Popis výsledku v původním jazyce

Cílem příspěvku je porovnání vybraných metod k analýze vzorků vod pro citlivou izolaci a následnou detekci virových částic. Jako izolační metody byly testovány metody filtrace přes kolony se skelnou vatou, membránové filtry a metoda přímé organické flokulace. Aby bylo možné ověřit účinnost testovaných metod a provádět jejich optimalizace, byly využity uměle připravené pseudovirionové částice odvozené od bakteriofága MS2 s unikátní vloženou sekvencí. Pro detekci byla použita reverzně transkripční polymerázová řetězová reakce probíhající v reálném čase. Tato metoda umožnila kvantifikaci virové nálože ve vzorku a tak stanovení účinnosti celého analytického postupu. Na základě výsledků a zkušeností byla vybrána metoda přímé organické flokulace jako nejvhodnější metoda izolace virových částic ze vzorků vod. Oproti ostatním metodám zde bylo možné opakovaně dosáhnout porovnatelných hodnot účinnosti. Metoda byla rovněž výhodná v jednoduchém a časově nenáročném provedení.

Název v anglickém jazyce

Isolation of viral particles from water samples

Popis výsledku anglicky

The aim of the contribution is the comparation of selected methods of water samples analysis for sensitive isolation and subsequent detection of viral particles. The methods of filtration through glass wool columns, membrane filters and direct organic flocculation were tested as isolation methods. In order to verify the effectiveness of the selected methods and to perform their optimization, artificially prepared viral particles derived from bacteriophage MS2 with a unique insert sequence were used. The reverse transcription polymerase chain reaction was used for detection. This method allowed quantification of viral load in sample and thus determination of the effectiveness of the entire analytical procedure. Based on the results and experience, the direct organic flocculation method was chosen as the most appropriate method for isolation of viral particles from water samples. Compared to other methods, it was repeatedly possible to achieve comparable efficacy values . The method was also advantageous because of its simple and time-consuming protocol.

Druh

O - Ostatní výsledky

CEP obor

—

OECD FORD obor

10606 - Microbiology

Projekt

—

Návaznosti

S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Rok uplatnění

2016

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů