Multi-Enzyme Pathway Optimisation Through Star-Shaped Reachable Sets

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F17%3A00099434" target="_blank" >RIV/00216224:14310/17:00099434 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://loschmidt.chemi.muni.cz/peg/wp-content/uploads/2017/10/9783319608150-c2.pdf" target="_blank" >https://loschmidt.chemi.muni.cz/peg/wp-content/uploads/2017/10/9783319608150-c2.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-60816-7_2" target="_blank" >10.1007/978-3-319-60816-7_2</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Multi-Enzyme Pathway Optimisation Through Star-Shaped Reachable Sets

Popis výsledku v původním jazyce

This article studies the time evolution of multi-enzyme pathways. The non-linearity of the problem coupled with the infinite dimensionality of the time-dependent input usually results in a rather laborious optimization. Here we discuss how the optimization of the input enzyme concentrations might be efficiently reduced to a calculation of reachable sets. Under some general conditions, the original system has star-shaped reachable sets that can be derived by solving a partial differential equation. This method allows a thorough study and optimization of quite sophisticated enzymatic pathways with non-linear dynamics and possible inhibition. Moreover, optimal control synthesis based on reachable sets can be implemented and was tested on several simulated examples.

Název v anglickém jazyce

Multi-Enzyme Pathway Optimisation Through Star-Shaped Reachable Sets

Popis výsledku anglicky

This article studies the time evolution of multi-enzyme pathways. The non-linearity of the problem coupled with the infinite dimensionality of the time-dependent input usually results in a rather laborious optimization. Here we discuss how the optimization of the input enzyme concentrations might be efficiently reduced to a calculation of reachable sets. Under some general conditions, the original system has star-shaped reachable sets that can be derived by solving a partial differential equation. This method allows a thorough study and optimization of quite sophisticated enzymatic pathways with non-linear dynamics and possible inhibition. Moreover, optimal control synthesis based on reachable sets can be implemented and was tested on several simulated examples.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

—

OECD FORD obor

10102 - Applied mathematics

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2017

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

11th International Conference on Practical Applications of Computational Biology & Bioinformatics

ISBN

9783319608167

ISSN

2194-5357

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

9

Strana od-do

9-17

Název nakladatele

Springer International Publishing

Místo vydání

Německo

Místo konání akce

Porto, Portugal

Datum konání akce

23. 6. 2017

Typ akce podle státní příslušnosti

WRD - Celosvětová akce

Kód UT WoS článku

000465514300002