Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

CalFitter: a web server for analysis of protein thermal denaturation data

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F18%3A00101753" target="_blank" >RIV/00216224:14310/18:00101753 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/00159816:_____/18:00069362 RIV/00216305:26230/18:PU140099

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1093/nar/gky358" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1093/nar/gky358</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1093/nar/gky358" target="_blank" >10.1093/nar/gky358</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    CalFitter: a web server for analysis of protein thermal denaturation data

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Despite significant advances in the understanding of protein structure-function relationships, revealing protein folding pathways still poses a challenge due to a limited number of relevant experimental tools. Widely-used experimental techniques, such as calorimetry or spectroscopy, critically depend on a proper data analysis. Currently, there are only separate data analysis tools available for each type of experiment with a limited model selection. To address this problem, we have developed the CalFitter web server to be a unified platform for comprehensive data fitting and analysis of protein thermal denaturation data. The server allows simultaneous global data fitting using any combination of input data types and offers 12 protein unfolding pathway models for selection, including irreversible transitions often missing from other tools. The data fitting produces optimal parameter values, their confidence intervals, and statistical information to define unfolding pathways. The server provides an interactive and easy-to-use interface that allows users to directly analyse input datasets and simulate modelled output based on the model parameters.

  • Název v anglickém jazyce

    CalFitter: a web server for analysis of protein thermal denaturation data

  • Popis výsledku anglicky

    Despite significant advances in the understanding of protein structure-function relationships, revealing protein folding pathways still poses a challenge due to a limited number of relevant experimental tools. Widely-used experimental techniques, such as calorimetry or spectroscopy, critically depend on a proper data analysis. Currently, there are only separate data analysis tools available for each type of experiment with a limited model selection. To address this problem, we have developed the CalFitter web server to be a unified platform for comprehensive data fitting and analysis of protein thermal denaturation data. The server allows simultaneous global data fitting using any combination of input data types and offers 12 protein unfolding pathway models for selection, including irreversible transitions often missing from other tools. The data fitting produces optimal parameter values, their confidence intervals, and statistical information to define unfolding pathways. The server provides an interactive and easy-to-use interface that allows users to directly analyse input datasets and simulate modelled output based on the model parameters.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10102 - Applied mathematics

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2018

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Nucleic Acids Research

  • ISSN

    0305-1048

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    46

  • Číslo periodika v rámci svazku

    W1

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    6

  • Strana od-do

    „W344“-„W349“

  • Kód UT WoS článku

    000438374100055

  • EID výsledku v databázi Scopus