Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Visualization of hydrogen atoms in a perdeuterated lectin-fucose complex reveals key details of protein-carbohydrate interactions

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F21%3A00119632" target="_blank" >RIV/00216224:14310/21:00119632 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/60077344:_____/21:00553202

  • Výsledek na webu

    <a href="https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0969212621000769?via%3Dihub" target="_blank" >https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0969212621000769?via%3Dihub</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.str.2021.03.003" target="_blank" >10.1016/j.str.2021.03.003</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Visualization of hydrogen atoms in a perdeuterated lectin-fucose complex reveals key details of protein-carbohydrate interactions

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Carbohydrate-binding proteins from pathogenic bacteria and fungi have been shown to be implicated in various pathological processes, where they interact with glycans present on the surface of the host cells. These interactions are part of the initial processes of infection of the host and are very important to study at the atomic level. Here, we report the roomtemperature neutron structures of PLL lectin from Photorhabdus laumondii in its apo form and in complex with deuterated L-fucose, which is, to our knowledge, the first neutron structure of a carbohydrate-binding protein in complex with a fully deuterated carbohydrate ligand. A detailed structural analysis of the lectin-carbohydrate interactions provides information on the hydrogen bond network, the role of water molecules, and the extent of the CH-pi stacking interactions between fucose and the aromatic amino acids in the binding site.

  • Název v anglickém jazyce

    Visualization of hydrogen atoms in a perdeuterated lectin-fucose complex reveals key details of protein-carbohydrate interactions

  • Popis výsledku anglicky

    Carbohydrate-binding proteins from pathogenic bacteria and fungi have been shown to be implicated in various pathological processes, where they interact with glycans present on the surface of the host cells. These interactions are part of the initial processes of infection of the host and are very important to study at the atomic level. Here, we report the roomtemperature neutron structures of PLL lectin from Photorhabdus laumondii in its apo form and in complex with deuterated L-fucose, which is, to our knowledge, the first neutron structure of a carbohydrate-binding protein in complex with a fully deuterated carbohydrate ligand. A detailed structural analysis of the lectin-carbohydrate interactions provides information on the hydrogen bond network, the role of water molecules, and the extent of the CH-pi stacking interactions between fucose and the aromatic amino acids in the binding site.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10608 - Biochemistry and molecular biology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/GA18-18964S" target="_blank" >GA18-18964S: Lektiny a jejich úloha v interakci patogen/hostitel a buněčném rozpoznávání</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2021

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Structure

  • ISSN

    0969-2126

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    29

  • Číslo periodika v rámci svazku

    9

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    15

  • Strana od-do

    „1003“-„1013.e4“

  • Kód UT WoS článku

    000692378500008

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85103976023