Genes associated with biological nitrogen fixation identified using RNAsequencing in red clover (Trifolium pratense L.)

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F21%3A00119861" target="_blank" >RIV/00216224:14310/21:00119861 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://fns.uniba.sk/fileadmin/prif/svk/zborniky/Zbornik2021.pdf" target="_blank" >https://fns.uniba.sk/fileadmin/prif/svk/zborniky/Zbornik2021.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Genes associated with biological nitrogen fixation identified using RNAsequencing in red clover (Trifolium pratense L.)

Popis výsledku v původním jazyce

Biological nitrogen fixation (BNF), commonly studied in the context of legume-Rhizobia symbiosis, is a key component of the nitrogen cycle in nature and efforts to use this process include e.g. utilization of plants as a natural fertilizers or generating crops with BNF using bioengineering. Despite the potential of using this process in plant breeding and many years of research, there is still a lack of information on the regulation of dozens and hundreds of genes connected with BNF. Here, we compared a root nodule transcriptome of red clover (Trifolium pratense L.) genotypes with contrast nitrogen fixation efficacy and by performing differential gene expression analysis we found 491 genes differentially expressed (DE) between plants with high and low BNF efficiency. Following annotation of DE genes revealed their function and enabled their connection with biosynthetic pathways. Overall, these results broaden our knowledge about transcriptomic landscape of red clover root nodules and connect the phenotypic trait of BNF efficiency with gene expression levels in situ.

Název v anglickém jazyce

Genes associated with biological nitrogen fixation identified using RNAsequencing in red clover (Trifolium pratense L.)

Popis výsledku anglicky

Biological nitrogen fixation (BNF), commonly studied in the context of legume-Rhizobia symbiosis, is a key component of the nitrogen cycle in nature and efforts to use this process include e.g. utilization of plants as a natural fertilizers or generating crops with BNF using bioengineering. Despite the potential of using this process in plant breeding and many years of research, there is still a lack of information on the regulation of dozens and hundreds of genes connected with BNF. Here, we compared a root nodule transcriptome of red clover (Trifolium pratense L.) genotypes with contrast nitrogen fixation efficacy and by performing differential gene expression analysis we found 491 genes differentially expressed (DE) between plants with high and low BNF efficiency. Following annotation of DE genes revealed their function and enabled their connection with biosynthetic pathways. Overall, these results broaden our knowledge about transcriptomic landscape of red clover root nodules and connect the phenotypic trait of BNF efficiency with gene expression levels in situ.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

—

OECD FORD obor

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)

Projekt

<a href="/cs/project/TH02010351" target="_blank" >TH02010351: Efektivní biotechnologie pro syntézu populačních čipů a její ověření na pilotní matrici rostlinného materiálu</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2021

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

Študentská vedecká konferencia PriF UK 2021: zborník recenzovaných príspevkov

ISBN

9788022351324

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

6

Strana od-do

498-503

Název nakladatele

Univerzita Komenského v Bratislave

Místo vydání

Bratislava

Místo konání akce

Bratislava

Datum konání akce

21. 4. 2021

Typ akce podle státní příslušnosti

EUR - Evropská akce

Kód UT WoS článku

—