Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Study of the interaction of the palmatine alkaloid with hybrid G-quadruplex/duplex and i-motif/duplex DNA structures

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F22%3A00125075" target="_blank" >RIV/00216224:14310/22:00125075 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0301462221001988" target="_blank" >https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0301462221001988</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.bpc.2021.106715" target="_blank" >10.1016/j.bpc.2021.106715</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Study of the interaction of the palmatine alkaloid with hybrid G-quadruplex/duplex and i-motif/duplex DNA structures

  • Popis výsledku v původním jazyce

    There is an increasing interest in the study of guanine or cytosine-rich sequences that may fold into G-quadruplex (G4) or i-motif (iM) structures showing a short hairpin (or stem-loop) stabilized by Watson-Crick base pairs. These hybrid spatial arrangements may be target of ligands that have been shown to interact strongly with BDNA. In this work, the interaction of the palmatine alkaloid with several sequences forming different G4s, iMs, and hybrid structures has been studied by means of spectroscopic and separation techniques, as well as multivariate data analysis methods. At the experimental conditions used in this work, the results have shown that this ligand strongly stabilizes parallel G4 structures, whereas a weaker interaction was observed with the antiparallel G4 adopted by the thrombin-binding aptamer or iMs. The presence of hairpins within the loops scarcely affects the affinity of this ligand for the hybrid G4/duplex or iM/duplex structures. Fluorescence measurements have provided evidence of a certain interaction with iMs at pH 5.1, despite the absence of thermal stabilization effects.

  • Název v anglickém jazyce

    Study of the interaction of the palmatine alkaloid with hybrid G-quadruplex/duplex and i-motif/duplex DNA structures

  • Popis výsledku anglicky

    There is an increasing interest in the study of guanine or cytosine-rich sequences that may fold into G-quadruplex (G4) or i-motif (iM) structures showing a short hairpin (or stem-loop) stabilized by Watson-Crick base pairs. These hybrid spatial arrangements may be target of ligands that have been shown to interact strongly with BDNA. In this work, the interaction of the palmatine alkaloid with several sequences forming different G4s, iMs, and hybrid structures has been studied by means of spectroscopic and separation techniques, as well as multivariate data analysis methods. At the experimental conditions used in this work, the results have shown that this ligand strongly stabilizes parallel G4 structures, whereas a weaker interaction was observed with the antiparallel G4 adopted by the thrombin-binding aptamer or iMs. The presence of hairpins within the loops scarcely affects the affinity of this ligand for the hybrid G4/duplex or iM/duplex structures. Fluorescence measurements have provided evidence of a certain interaction with iMs at pH 5.1, despite the absence of thermal stabilization effects.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10403 - Physical chemistry

Návaznosti výsledku

  • Projekt

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2022

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Biophysical Chemistry

  • ISSN

    0301-4622

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    281

  • Číslo periodika v rámci svazku

    FEB

  • Stát vydavatele periodika

    NL - Nizozemsko

  • Počet stran výsledku

    8

  • Strana od-do

    1-8

  • Kód UT WoS článku

    000722102000002

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85119045844