Exprese genů u kolorektálního karcinomu určená pomocí cDNA mikročipů užitím kombinace několika vyhodnocovacích postupů

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14330%2F04%3A00009700" target="_blank" >RIV/00216224:14330/04:00009700 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/68081707:_____/04:00108488

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Gene expression in colorectal carcinoma determined by cDNA microarrays using a combination of several evaluation approaches.

Popis výsledku v původním jazyce

We have compared colorectal carcinoma tissues with parallel samples of epithelial tissue and identified, by means of Human 1.7K cDNA microarrays, a set of genes with significantly altered expression in 12 patients. We used a combination of several approaches of microarray data analysis to be sure that the results were reliable. Although we have found differences between the results obtained by various image analysis software packages and using different statistical tools, we have identified the group of22 genes with significantly altered expression in colorectal carcinoma tissue as compared with epithelial tissue using all evaluation approaches. Hierarchical clustering showed the possibility of dividing the patients into two groups according to the presence of metastases in regional lymph nodes. We have proposed 6 genes as potential markers for the detection of the presence of regional metastases in patients. We suppose that the proposed advance in the analysis of microarray data coul

Název v anglickém jazyce

Gene expression in colorectal carcinoma determined by cDNA microarrays using a combination of several evaluation approaches.

Popis výsledku anglicky

We have compared colorectal carcinoma tissues with parallel samples of epithelial tissue and identified, by means of Human 1.7K cDNA microarrays, a set of genes with significantly altered expression in 12 patients. We used a combination of several approaches of microarray data analysis to be sure that the results were reliable. Although we have found differences between the results obtained by various image analysis software packages and using different statistical tools, we have identified the group of22 genes with significantly altered expression in colorectal carcinoma tissue as compared with epithelial tissue using all evaluation approaches. Hierarchical clustering showed the possibility of dividing the patients into two groups according to the presence of metastases in regional lymph nodes. We have proposed 6 genes as potential markers for the detection of the presence of regional metastases in patients. We suppose that the proposed advance in the analysis of microarray data coul

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2004

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

Biophysics of the Genome

ISBN

80-210-3560-9

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

9

Strana od-do

29-37

Název nakladatele

Masaryk University

Místo vydání

Brno

Místo konání akce

Brno

Datum konání akce

12. 10. 2004

Typ akce podle státní příslušnosti

EUR - Evropská akce

Kód UT WoS článku

—