Výpočet tunelů se zohledněním doplňujících kritérií

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14330%2F08%3A00024595" target="_blank" >RIV/00216224:14330/08:00024595 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Multicriteria tunnel computation

Popis výsledku v původním jazyce

Recent approaches to tunnel computation in protein molecules based on computational geometry are able to satisfactorily compute the narrowest possible width of any tunnel leading from a specified position inside the protein molecule to its surface. However, chemists are not only interested in the minimal width of a tunnel, they would also like to consider other criteria such as the length of the tunnel or its volume. In this paper we present an extension of the recent approach to tunnel computation which could take these other criteria into account. Using Delaunay triangulation we compute the set of all the tunnels which have the widest possible narrowest part, and select the best representative of this set in view of its additional criteria. Even though the extension is straightforward, it has many useful practical impacts. The major contribution of this approach is that it allows us to evaluate dynamic properties of protein molecules by tracing a computed tunnel in the sequence of se

Název v anglickém jazyce

Multicriteria tunnel computation

Popis výsledku anglicky

Recent approaches to tunnel computation in protein molecules based on computational geometry are able to satisfactorily compute the narrowest possible width of any tunnel leading from a specified position inside the protein molecule to its surface. However, chemists are not only interested in the minimal width of a tunnel, they would also like to consider other criteria such as the length of the tunnel or its volume. In this paper we present an extension of the recent approach to tunnel computation which could take these other criteria into account. Using Delaunay triangulation we compute the set of all the tunnels which have the widest possible narrowest part, and select the best representative of this set in view of its additional criteria. Even though the extension is straightforward, it has many useful practical impacts. The major contribution of this approach is that it allows us to evaluate dynamic properties of protein molecules by tracing a computed tunnel in the sequence of se

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

JC - Počítačový hardware a software

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2008

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

Multicriteria tunnel computation

ISBN

978-0-88986-720-8

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

5

Strana od-do

—

Název nakladatele

ACTA Press

Místo vydání

Innsbruck, Rakousko

Místo konání akce

Innsbruck, Austria

Datum konání akce

13. 2. 2008

Typ akce podle státní příslušnosti

EUR - Evropská akce

Kód UT WoS článku

—