Výpočet tunelů v proteinech pomocí Delaunayovy triangulace

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14330%2F07%3A00020120" target="_blank" >RIV/00216224:14330/07:00020120 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Computation of tunnels in protein molecules using Delaunay triangulation

Popis výsledku v původním jazyce

This paper presents a new method of specific cavity analysis in protein molecules. Long-term biochemical research has the discovery that protein molecule behaviour depends on the existence of cavities (tunnels) leading from the inside of the molecule toits surface. Previous methods of tunnel computation were based on space rasterization. Our approach is based on computational geometry and uses Voronoi diagram and Delaunay triangulation. Our method computes tunnels with better quality in reasonable computational time. The proposed algorithm was implemented and tested on several real protein molecules and is expected to be used in various applications in protein modelling and analysis. This is an interesting example of applying computational geometry principles to practical problems.

Název v anglickém jazyce

Computation of tunnels in protein molecules using Delaunay triangulation

Popis výsledku anglicky

This paper presents a new method of specific cavity analysis in protein molecules. Long-term biochemical research has the discovery that protein molecule behaviour depends on the existence of cavities (tunnels) leading from the inside of the molecule toits surface. Previous methods of tunnel computation were based on space rasterization. Our approach is based on computational geometry and uses Voronoi diagram and Delaunay triangulation. Our method computes tunnels with better quality in reasonable computational time. The proposed algorithm was implemented and tested on several real protein molecules and is expected to be used in various applications in protein modelling and analysis. This is an interesting example of applying computational geometry principles to practical problems.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

IN - Informatika

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2007

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

Journal of WSCG

ISBN

978-80-86943-00-8

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

8

Strana od-do

107-114

Název nakladatele

University of West Bohemia

Místo vydání

Plzeň

Místo konání akce

Plzeň

Datum konání akce

1. 1. 2007

Typ akce podle státní příslušnosti

WRD - Celosvětová akce

Kód UT WoS článku

—