Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

In silico search for secondary structures in p53 target genes using R/Bioconductor

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14330%2F13%3A00068953" target="_blank" >RIV/00216224:14330/13:00068953 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://www.researchgate.net/publication/254257375_In_silico_search_for_secondary_structures_in_p53_target_genes_using_RBioconductor?ev=prf_pub" target="_blank" >https://www.researchgate.net/publication/254257375_In_silico_search_for_secondary_structures_in_p53_target_genes_using_RBioconductor?ev=prf_pub</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    In silico search for secondary structures in p53 target genes using R/Bioconductor

  • Popis výsledku v původním jazyce

    p53 is a well-known transcription factor and tumor suppressor, regulating among other processes, the commitment of cells to apoptosis and DNA repair. p53 mutants are often found in cancers of different kinds, ei- ther as mutant or misregulated p53. p53 is involved in many other processes and we currently do not understand the full range of its functions. It is known to recognize the p53con sequence by its specific DNA-binding domain (DBD). It is also known to bind DNA non-specifically. This binding hasbeen shown to involve superhelical DNA, more specifically, cruciform, triplex and quadruplex struc- tures. In our laboratories we were intrigued by the possi- ble interplay between non-canonical DNA structure bind- ing and regular p53con binding. In an attempt to clarify this interplay and discover suitable candidate genes for fur- ther study, we carried out an in silico study on the human genome.

  • Název v anglickém jazyce

    In silico search for secondary structures in p53 target genes using R/Bioconductor

  • Popis výsledku anglicky

    p53 is a well-known transcription factor and tumor suppressor, regulating among other processes, the commitment of cells to apoptosis and DNA repair. p53 mutants are often found in cancers of different kinds, ei- ther as mutant or misregulated p53. p53 is involved in many other processes and we currently do not understand the full range of its functions. It is known to recognize the p53con sequence by its specific DNA-binding domain (DBD). It is also known to bind DNA non-specifically. This binding hasbeen shown to involve superhelical DNA, more specifically, cruciform, triplex and quadruplex struc- tures. In our laboratories we were intrigued by the possi- ble interplay between non-canonical DNA structure bind- ing and regular p53con binding. In an attempt to clarify this interplay and discover suitable candidate genes for fur- ther study, we carried out an in silico study on the human genome.

Klasifikace

  • Druh

    D - Stať ve sborníku

  • CEP obor

    IN - Informatika

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/LG13010" target="_blank" >LG13010: Zastoupení ČR v European Research Consortium for Informatics and Mathematics</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2013

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název statě ve sborníku

    ITAT 2013: Information Technologies - Applications and Theory (Workshops, Posters, and Tutorials)

  • ISBN

    149095208X

  • ISSN

  • e-ISSN

  • Počet stran výsledku

    5

  • Strana od-do

    42-46

  • Název nakladatele

    CreateSpace Independent Publishing Platform

  • Místo vydání

    Neuvedeno

  • Místo konání akce

    Donovaly, SVK

  • Datum konání akce

    11. 9. 2013

  • Typ akce podle státní příslušnosti

    EUR - Evropská akce

  • Kód UT WoS článku