Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Uneven distribution of potential triplex sequences in the human genome. In silico study using the R/Bioconductor package triplex.

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14330%2F14%3A00074890" target="_blank" >RIV/00216224:14330/14:00074890 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/00216305:26230/14:PU111943

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.5220/0004824100800088" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.5220/0004824100800088</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.5220/0004824100800088" target="_blank" >10.5220/0004824100800088</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Uneven distribution of potential triplex sequences in the human genome. In silico study using the R/Bioconductor package triplex.

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Eukaryotic genomes are rich in sequences capable of forming non-B DNA structures. These structures are expected to play important roles in natural regulatory processes at levels above those of individual genes, such as whole genome dynamics or chromatinorganization, as well as in processes leading to the loss of these functions, such as cancer development. Recently, a number of authors have mapped the occurrence of potential quadruplex sequences in the human genome and found them to be associated withpromoters. In this paper, we set out to map the distribution and characteristics of potential triplex-forming sequences in human genome DNA sequences. Using the R/Bioconductor package {it triplex}, we found these sequences to be excluded from exons, while present mostly in a small number of repetitive sequence classes, especially short sequence tandem repeats (microsatellites), Alu and combined elements, such as SVA.

  • Název v anglickém jazyce

    Uneven distribution of potential triplex sequences in the human genome. In silico study using the R/Bioconductor package triplex.

  • Popis výsledku anglicky

    Eukaryotic genomes are rich in sequences capable of forming non-B DNA structures. These structures are expected to play important roles in natural regulatory processes at levels above those of individual genes, such as whole genome dynamics or chromatinorganization, as well as in processes leading to the loss of these functions, such as cancer development. Recently, a number of authors have mapped the occurrence of potential quadruplex sequences in the human genome and found them to be associated withpromoters. In this paper, we set out to map the distribution and characteristics of potential triplex-forming sequences in human genome DNA sequences. Using the R/Bioconductor package {it triplex}, we found these sequences to be excluded from exons, while present mostly in a small number of repetitive sequence classes, especially short sequence tandem repeats (microsatellites), Alu and combined elements, such as SVA.

Klasifikace

  • Druh

    D - Stať ve sborníku

  • CEP obor

    IN - Informatika

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2014

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název statě ve sborníku

    Proceedings of the International Conference on Bioinformatics Models, Methods and Algorithms

  • ISBN

    9789897580123

  • ISSN

  • e-ISSN

  • Počet stran výsledku

    9

  • Strana od-do

    80-88

  • Název nakladatele

    SciTePress

  • Místo vydání

    Angers, France

  • Místo konání akce

    Angers, FR

  • Datum konání akce

    3. 3. 2014

  • Typ akce podle státní příslušnosti

    WRD - Celosvětová akce

  • Kód UT WoS článku