Characterization of the Role of Collagen Network Structure and Composition in Cancer Cell Migration
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14330%2F15%3A00080823" target="_blank" >RIV/00216224:14330/15:00080823 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1109/EMBC.2015.7320283" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1109/EMBC.2015.7320283</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1109/EMBC.2015.7320283" target="_blank" >10.1109/EMBC.2015.7320283</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Characterization of the Role of Collagen Network Structure and Composition in Cancer Cell Migration
Popis výsledku v původním jazyce
The geometry of 3D collagen networks is a key factor that influences the behavior of live cells within extracellular matrices. This paper presents a method for automatic quantification of the 3D collagen network geometry with fiber resolution in confocalreflection microscopy images. The proposed method is based on a smoothing filter and binarization of the collagen network followed by a fiber reconstruction algorithm. The method is validated on 3D collagen gels with various collagen and Matrigel concentrations. The results reveal that Matrigel affects the collagen network geometry by decreasing the network pore size while preserving the fiber length and fiber persistence length. The influence of network composition and geometry, especially pore size,is preliminarily analyzed by quantifying the migration patterns of lung cancer cells within microfluidic devices filled with three different hydrogel types. The experiments reveal that Matrigel, while decreasing pore size, stimulates cell
Název v anglickém jazyce
Characterization of the Role of Collagen Network Structure and Composition in Cancer Cell Migration
Popis výsledku anglicky
The geometry of 3D collagen networks is a key factor that influences the behavior of live cells within extracellular matrices. This paper presents a method for automatic quantification of the 3D collagen network geometry with fiber resolution in confocalreflection microscopy images. The proposed method is based on a smoothing filter and binarization of the collagen network followed by a fiber reconstruction algorithm. The method is validated on 3D collagen gels with various collagen and Matrigel concentrations. The results reveal that Matrigel affects the collagen network geometry by decreasing the network pore size while preserving the fiber length and fiber persistence length. The influence of network composition and geometry, especially pore size,is preliminarily analyzed by quantifying the migration patterns of lung cancer cells within microfluidic devices filled with three different hydrogel types. The experiments reveal that Matrigel, while decreasing pore size, stimulates cell
Klasifikace
Druh
D - Stať ve sborníku
CEP obor
IN - Informatika
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2015
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název statě ve sborníku
37th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society
ISBN
9781424492718
ISSN
1557-170X
e-ISSN
—
Počet stran výsledku
4
Strana od-do
8139-8142
Název nakladatele
IEEE
Místo vydání
Milano
Místo konání akce
Milano
Datum konání akce
25. 8. 2015
Typ akce podle státní příslušnosti
WRD - Celosvětová akce
Kód UT WoS článku
000371717208103