pqsfinder: identification of potential quadruplex forming sequences
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14330%2F17%3A00094706" target="_blank" >RIV/00216224:14330/17:00094706 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/pqsfinder.html" target="_blank" >http://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/pqsfinder.html</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.18129/B9.bioc.pqsfinder" target="_blank" >10.18129/B9.bioc.pqsfinder</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
pqsfinder: identification of potential quadruplex forming sequences
Popis výsledku v původním jazyce
The main functionality of the this package is to detect DNA sequence patterns that are likely to fold into an intramolecular G-quadruplex (G4). Unlike many other approaches, this package is able to detect sequences responsible for G4s folded from imperfect G-runs containing bulges or mismatches and as such is more sensitive than competing algorithms.
Název v anglickém jazyce
pqsfinder: identification of potential quadruplex forming sequences
Popis výsledku anglicky
The main functionality of the this package is to detect DNA sequence patterns that are likely to fold into an intramolecular G-quadruplex (G4). Unlike many other approaches, this package is able to detect sequences responsible for G4s folded from imperfect G-runs containing bulges or mismatches and as such is more sensitive than competing algorithms.
Klasifikace
Druh
R - Software
CEP obor
—
OECD FORD obor
10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/GA15-02891S" target="_blank" >GA15-02891S: Rostlinné transpozony a konformace DNA</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2017
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Interní identifikační kód produktu
pqsfinder
Technické parametry
Součást prostředí R-Bioconductor
Ekonomické parametry
neznámé
IČO vlastníka výsledku
00216305
Název vlastníka
VUT Brno