pqsfinder: an R/Bioconductor package for identification of potential quadruplex forming sequences

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216305%3A26230%2F16%3APR28895" target="_blank" >RIV/00216305:26230/16:PR28895 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/pqsfinder.html" target="_blank" >http://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/pqsfinder.html</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

pqsfinder: an R/Bioconductor package for identification of potential quadruplex forming sequences

Popis výsledku v původním jazyce

The main functionality of the this package is to detect DNA sequence patterns that are likely to fold into an intramolecular G-quadruplex (G4). Unlike many other approaches, this package is able to detect sequences responsible for G4s folded from imperfect G-runs containing bulges or mismatches and as such is more sensitive than competing algorithms.

Název v anglickém jazyce

pqsfinder: an R/Bioconductor package for identification of potential quadruplex forming sequences

Popis výsledku anglicky

The main functionality of the this package is to detect DNA sequence patterns that are likely to fold into an intramolecular G-quadruplex (G4). Unlike many other approaches, this package is able to detect sequences responsible for G4s folded from imperfect G-runs containing bulges or mismatches and as such is more sensitive than competing algorithms.

Druh

R - Software

CEP obor

JC - Počítačový hardware a software

OECD FORD obor

—

Projekt

—

Návaznosti

S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Rok uplatnění

2016

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

pqsfinder

Technické parametry

Volně šiřitelný software poskytovaný pod licencí BSD (přesné znění licence je dostupné na stránce http://www.opensource.org/licenses/bsd-license.php).Pro informace o licenčních podmínkách prosím kontaktujte: Mgr. Radka Báčová, Výzkumné centrum informačních technologií, Fakulta informačních technologií VUT v Brně, Božetěchova 2, 612 66 Brno, 541 141 473.

Ekonomické parametry

Volně šiřitelný software poskytovaný pod licencí BSD.

IČO vlastníka výsledku

—

Název vlastníka

Fakulta informačních technologií