Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Image Processing in Cryo-Electron Microscopy of Single Particles: The Power of Combining Methods

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14330%2F21%3A00122290" target="_blank" >RIV/00216224:14330/21:00122290 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-1406-8_13" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-1406-8_13</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-1406-8_13" target="_blank" >10.1007/978-1-0716-1406-8_13</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Image Processing in Cryo-Electron Microscopy of Single Particles: The Power of Combining Methods

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Cryo-electron microscopy has established as a mature structural biology technique to elucidate the three-dimensional structure of biological macromolecules. The Coulomb potential of the sample is imaged by an electron beam, and fast semi-conductor detectors produce movies of the sample under study. These movies have to be further processed by a whole pipeline of image-processing algorithms that produce the final structure of the macromolecule. In this chapter, we illustrate this whole processing pipeline putting in value the strength of "meta algorithms," which are the combination of several algorithms, each one with different mathematical rationale, in order to distinguish correctly from incorrectly estimated parameters. We show how this strategy leads to superior performance of the whole pipeline as well as more confident assessments about the reconstructed structures. The "meta algorithms" strategy is common to many fields and, in particular, it has provided excellent results in bioinformatics. We illustrate this combination using the workflow engine, Scipion.

  • Název v anglickém jazyce

    Image Processing in Cryo-Electron Microscopy of Single Particles: The Power of Combining Methods

  • Popis výsledku anglicky

    Cryo-electron microscopy has established as a mature structural biology technique to elucidate the three-dimensional structure of biological macromolecules. The Coulomb potential of the sample is imaged by an electron beam, and fast semi-conductor detectors produce movies of the sample under study. These movies have to be further processed by a whole pipeline of image-processing algorithms that produce the final structure of the macromolecule. In this chapter, we illustrate this whole processing pipeline putting in value the strength of "meta algorithms," which are the combination of several algorithms, each one with different mathematical rationale, in order to distinguish correctly from incorrectly estimated parameters. We show how this strategy leads to superior performance of the whole pipeline as well as more confident assessments about the reconstructed structures. The "meta algorithms" strategy is common to many fields and, in particular, it has provided excellent results in bioinformatics. We illustrate this combination using the workflow engine, Scipion.

Klasifikace

  • Druh

    C - Kapitola v odborné knize

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/EF16_013%2F0001802" target="_blank" >EF16_013/0001802: CERIT Scientific Cloud</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2021

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název knihy nebo sborníku

    Structural Proteomics

  • ISBN

    9781071614051

  • Počet stran výsledku

    33

  • Strana od-do

    257-289

  • Počet stran knihy

    344

  • Název nakladatele

    Springer US

  • Místo vydání

    Clifton, N.J.

  • Kód UT WoS kapitoly

    000691017300014