Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

FlexAlign: An Accurate and Fast Algorithm for Movie Alignment in Cryo-Electron Microscopy

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14610%2F20%3A00116269" target="_blank" >RIV/00216224:14610/20:00116269 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://www.mdpi.com/2079-9292/9/6/1040" target="_blank" >https://www.mdpi.com/2079-9292/9/6/1040</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.3390/electronics9061040" target="_blank" >10.3390/electronics9061040</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    FlexAlign: An Accurate and Fast Algorithm for Movie Alignment in Cryo-Electron Microscopy

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Cryogenic Electron Microscopy (Cryo-EM) has been established as one of the key players in Structural Biology. It can reconstruct a 3D model of the sample at the near-atomic resolution, which led to a Method of the year award by Nature, and the Nobel Prize in 2017. With the growing number of facilities, faster microscopes, and new imaging techniques, new algorithms are needed to process the so-called movies data produced by the microscopes in real-time, while preserving a high resolution and maximum of additional information. In this article, we present a new algorithm used for movie alignment, called FlexAlign. FlexAlign is able to correctly compensate for the shift produced during the movie acquisition on-the-fly, using the current generation of hardware. The algorithm performs a global and elastic local registration of the movie frames using Cross-Correlation and B-spline interpolation for high precision. We show that our execution time is compatible with real-time correction and that we preserve the high-resolution information up to high frequency.

  • Název v anglickém jazyce

    FlexAlign: An Accurate and Fast Algorithm for Movie Alignment in Cryo-Electron Microscopy

  • Popis výsledku anglicky

    Cryogenic Electron Microscopy (Cryo-EM) has been established as one of the key players in Structural Biology. It can reconstruct a 3D model of the sample at the near-atomic resolution, which led to a Method of the year award by Nature, and the Nobel Prize in 2017. With the growing number of facilities, faster microscopes, and new imaging techniques, new algorithms are needed to process the so-called movies data produced by the microscopes in real-time, while preserving a high resolution and maximum of additional information. In this article, we present a new algorithm used for movie alignment, called FlexAlign. FlexAlign is able to correctly compensate for the shift produced during the movie acquisition on-the-fly, using the current generation of hardware. The algorithm performs a global and elastic local registration of the movie frames using Cross-Correlation and B-spline interpolation for high precision. We show that our execution time is compatible with real-time correction and that we preserve the high-resolution information up to high frequency.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/EF16_013%2F0001802" target="_blank" >EF16_013/0001802: CERIT Scientific Cloud</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2020

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Electronics

  • ISSN

    2079-9292

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    9

  • Číslo periodika v rámci svazku

    6

  • Stát vydavatele periodika

    CH - Švýcarská konfederace

  • Počet stran výsledku

    25

  • Strana od-do

    1-25

  • Kód UT WoS článku

    000551113800001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85086840250