Aeon 2021: Bifurcation Decision Trees in Boolean Networks
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14330%2F21%3A00124485" target="_blank" >RIV/00216224:14330/21:00124485 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-85633-5_14" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-85633-5_14</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-85633-5_14" target="_blank" >10.1007/978-3-030-85633-5_14</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Aeon 2021: Bifurcation Decision Trees in Boolean Networks
Popis výsledku v původním jazyce
Aeon is a recent tool which enables efficient analysis of long-term behaviour of asynchronous Boolean networks with unknown parameters. In this tool paper, we present a novel major release of Aeon (Aeon 2021) which introduces substantial new features compared to the original version. These include (i) enhanced static analysis functionality that verifies integrity of the Boolean network with its regulatory graph; (ii) state-space visualisation of individual attractors; (iii) stability analysis of network variables with respect to parameters; and finally, (iv) a novel decision-tree based interactive visualisation module allowing the exploration of complex relationships between parameters and network behaviour. Aeon 2021 is open-source, fully compatible with SBML-qual models, and available as an online application with an independent native compute engine responsible for resource-intensive tasks. The paper artefact is available via https://doi.org/10.5281/zenodo.5008293.
Název v anglickém jazyce
Aeon 2021: Bifurcation Decision Trees in Boolean Networks
Popis výsledku anglicky
Aeon is a recent tool which enables efficient analysis of long-term behaviour of asynchronous Boolean networks with unknown parameters. In this tool paper, we present a novel major release of Aeon (Aeon 2021) which introduces substantial new features compared to the original version. These include (i) enhanced static analysis functionality that verifies integrity of the Boolean network with its regulatory graph; (ii) state-space visualisation of individual attractors; (iii) stability analysis of network variables with respect to parameters; and finally, (iv) a novel decision-tree based interactive visualisation module allowing the exploration of complex relationships between parameters and network behaviour. Aeon 2021 is open-source, fully compatible with SBML-qual models, and available as an online application with an independent native compute engine responsible for resource-intensive tasks. The paper artefact is available via https://doi.org/10.5281/zenodo.5008293.
Klasifikace
Druh
D - Stať ve sborníku
CEP obor
—
OECD FORD obor
10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
S - Specificky vyzkum na vysokych skolach
Ostatní
Rok uplatnění
2021
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název statě ve sborníku
International Conference on Computational Methods in Systems Biology (CMSB 2021)
ISBN
9783030856328
ISSN
0302-9743
e-ISSN
—
Počet stran výsledku
8
Strana od-do
230-237
Název nakladatele
Springer
Místo vydání
Cham
Místo konání akce
Bordeaux
Datum konání akce
1. 1. 2021
Typ akce podle státní příslušnosti
WRD - Celosvětová akce
Kód UT WoS článku
—