Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Unfolding of Parametric Boolean Networks

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14330%2F18%3A00100911" target="_blank" >RIV/00216224:14330/18:00100911 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.entcs.2018.03.009" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1016/j.entcs.2018.03.009</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.entcs.2018.03.009" target="_blank" >10.1016/j.entcs.2018.03.009</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Unfolding of Parametric Boolean Networks

  • Popis výsledku v původním jazyce

    In systems biology, models of cellular regulatory processes such as gene regulatory networks or signalling pathways are crucial to understanding the behaviour of living cells. Available biological data are however often insufficient for full model specification. In this paper, we focus on partially specified models where the missing information is abstracted in the form of parameters. We introduce a novel approach to analysis of parametric logical regulatory networks addressing both sources of combinatoric explosion native to the model. First, we introduce a new compact representation of admissible parameters using Boolean lattices. Then, we define the unfolding of parametric Boolean networks. The resulting structure provides a partial-order reduction of concurrent transitions, and factorises the common transitions among the concrete models. A comparison is performed against state-of-the-art approaches to parametric model analysis

  • Název v anglickém jazyce

    Unfolding of Parametric Boolean Networks

  • Popis výsledku anglicky

    In systems biology, models of cellular regulatory processes such as gene regulatory networks or signalling pathways are crucial to understanding the behaviour of living cells. Available biological data are however often insufficient for full model specification. In this paper, we focus on partially specified models where the missing information is abstracted in the form of parameters. We introduce a novel approach to analysis of parametric logical regulatory networks addressing both sources of combinatoric explosion native to the model. First, we introduce a new compact representation of admissible parameters using Boolean lattices. Then, we define the unfolding of parametric Boolean networks. The resulting structure provides a partial-order reduction of concurrent transitions, and factorises the common transitions among the concrete models. A comparison is performed against state-of-the-art approaches to parametric model analysis

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>SC</sub> - Článek v periodiku v databázi SCOPUS

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/GA15-11089S" target="_blank" >GA15-11089S: Získávání parametrů biologických modelů pomocí techniky ověřování modelů</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2018

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Electronic Notes in Theoretical Computer Science

  • ISSN

    1571-0661

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    335

  • Číslo periodika v rámci svazku

    Duben 2018

  • Stát vydavatele periodika

    NL - Nizozemsko

  • Počet stran výsledku

    24

  • Strana od-do

    67-90

  • Kód UT WoS článku

    000430334800005

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85045239193