Cell Tracking based on Integer Linear Programming and Probability Scores

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14330%2F24%3A00135682" target="_blank" >RIV/00216224:14330/24:00135682 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://dx.doi.org/10.1109/ISBI56570.2024.10635857" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1109/ISBI56570.2024.10635857</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1109/ISBI56570.2024.10635857" target="_blank" >10.1109/ISBI56570.2024.10635857</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Cell Tracking based on Integer Linear Programming and Probability Scores

Popis výsledku v původním jazyce

The cell tracking problem can be formulated as a global optimization problem based on integer linear (IL) programming. The obtained solution depends on the definition of the IL program and the chosen costs of the events considered in the problem formulation. In general, balancing meaningful costs across different events is difficult. To simplify this problem, we propose a cost assignment approach based on probability scores, allowing us to easily interpret the free parameters. The idea is presented based on the BF-C2DL-HSC dataset from the Cell Tracking Challenge. We show our method reaches state-of-the-art performance when evaluating both technical and biological tracking measures.

Název v anglickém jazyce

Cell Tracking based on Integer Linear Programming and Probability Scores

Popis výsledku anglicky

The cell tracking problem can be formulated as a global optimization problem based on integer linear (IL) programming. The obtained solution depends on the definition of the IL program and the chosen costs of the events considered in the problem formulation. In general, balancing meaningful costs across different events is difficult. To simplify this problem, we propose a cost assignment approach based on probability scores, allowing us to easily interpret the free parameters. The idea is presented based on the BF-C2DL-HSC dataset from the Cell Tracking Challenge. We show our method reaches state-of-the-art performance when evaluating both technical and biological tracking measures.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

—

OECD FORD obor

10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)

Projekt

<a href="/cs/project/GA21-20374S" target="_blank" >GA21-20374S: Segmentace a sledování buněk se složitým tvarem</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2024

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

Athens, Greece, IEEE 21th International Symposium on Biomedical Imaging

ISBN

9798350313345

ISSN

1945-7928

e-ISSN

1945-8452

Počet stran výsledku

5

Strana od-do

1-5

Název nakladatele

IEEE 21th International Symposium on Biomedical Imaging

Místo vydání

Athens

Místo konání akce

Athens

Datum konání akce

1. 1. 2024

Typ akce podle státní příslušnosti

WRD - Celosvětová akce

Kód UT WoS článku

001305705103157