Flexible workflows for on-the-fly electron-microscopy single-particle image processing using Scipion
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14610%2F19%3A00111213" target="_blank" >RIV/00216224:14610/19:00111213 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1107/S2059798319011860" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1107/S2059798319011860</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1107/S2059798319011860" target="_blank" >10.1107/S2059798319011860</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Flexible workflows for on-the-fly electron-microscopy single-particle image processing using Scipion
Popis výsledku v původním jazyce
Electron microscopy of macromolecular structures is an approach that is in increasing demand in the field of structural biology. The automation of image acquisition has greatly increased the potential throughput of electron microscopy. Here, the focus is on the possibilities in Scipion to implement flexible and robust image-processing workflows that allow the electron-microscope operator and the user to monitor the quality of image acquisition, assessing very simple acquisition measures or obtaining a first estimate of the initial volume, or the data resolution and heterogeneity, without any need for programming skills. These workflows can implement intelligent automatic decisions and they can warn the user of possible acquisition failures. These concepts are illustrated by analysis of the well known 2.2 A resolution beta-galactosidase data set.
Název v anglickém jazyce
Flexible workflows for on-the-fly electron-microscopy single-particle image processing using Scipion
Popis výsledku anglicky
Electron microscopy of macromolecular structures is an approach that is in increasing demand in the field of structural biology. The automation of image acquisition has greatly increased the potential throughput of electron microscopy. Here, the focus is on the possibilities in Scipion to implement flexible and robust image-processing workflows that allow the electron-microscope operator and the user to monitor the quality of image acquisition, assessing very simple acquisition measures or obtaining a first estimate of the initial volume, or the data resolution and heterogeneity, without any need for programming skills. These workflows can implement intelligent automatic decisions and they can warn the user of possible acquisition failures. These concepts are illustrated by analysis of the well known 2.2 A resolution beta-galactosidase data set.
Klasifikace
Druh
J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science
CEP obor
—
OECD FORD obor
10600 - Biological sciences
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2019
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Acta Crystallographica Section D
ISSN
2059-7983
e-ISSN
—
Svazek periodika
75
Číslo periodika v rámci svazku
10
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
13
Strana od-do
882-894
Kód UT WoS článku
000497657100003
EID výsledku v databázi Scopus
2-s2.0-85072916357