Interpretation of karyotype evolution should consider chromosome structural constraints

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F11%3A00049462" target="_blank" >RIV/00216224:14740/11:00049462 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.tig.2011.03.004" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1016/j.tig.2011.03.004</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.tig.2011.03.004" target="_blank" >10.1016/j.tig.2011.03.004</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Interpretation of karyotype evolution should consider chromosome structural constraints

Popis výsledku v původním jazyce

Comparative genetics, genomics and cytogenetics provide tools to trace the evolutionary history of extant genomes. Yet, the interpretation of rapidly increasing genomic data is not always done in agreement with constraints determined by chromosome structural features and by insights obtained from chromosome mutagenesis. The terms 'non-reciprocal chromosome translocation', 'chromosome fusion' and 'centromere shift' used to explain genomic differences among organisms are misleading and often do not correctly reflect the mechanisms of chromosome rearrangements underlying the evolutionary karyotypic variation. Here, we (re)interpret evolutionary genome alterations in a parsimonious way and demonstrate that results of comparative genomics and comparative chromosome painting can be explained on the basis of known primary and secondary chromosome rearrangements. Therefore, some widespread terms used in comparative and evolutionary genomics should be either avoided or redefined.

Název v anglickém jazyce

Interpretation of karyotype evolution should consider chromosome structural constraints

Popis výsledku anglicky

Comparative genetics, genomics and cytogenetics provide tools to trace the evolutionary history of extant genomes. Yet, the interpretation of rapidly increasing genomic data is not always done in agreement with constraints determined by chromosome structural features and by insights obtained from chromosome mutagenesis. The terms 'non-reciprocal chromosome translocation', 'chromosome fusion' and 'centromere shift' used to explain genomic differences among organisms are misleading and often do not correctly reflect the mechanisms of chromosome rearrangements underlying the evolutionary karyotypic variation. Here, we (re)interpret evolutionary genome alterations in a parsimonious way and demonstrate that results of comparative genomics and comparative chromosome painting can be explained on the basis of known primary and secondary chromosome rearrangements. Therefore, some widespread terms used in comparative and evolutionary genomics should be either avoided or redefined.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/IAA601630902" target="_blank" >IAA601630902: Evoluce chromosomů brukvovitých (Brassicaceae) analyzována pomocí komparativního chromosomálního paintingu</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2011

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Trends in Genetics

ISSN

0168-9525

e-ISSN

—

Svazek periodika

27

Číslo periodika v rámci svazku

6

Stát vydavatele periodika

GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

Počet stran výsledku

10

Strana od-do

207-216

Kód UT WoS článku

000291567400001

EID výsledku v databázi Scopus

—