Air2p is critical for the assembly and RNA-binding of the TRAMP complex and the KOW domain of Mtr4p is crucial for exosome activation
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F12%3A00057391" target="_blank" >RIV/00216224:14740/12:00057391 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://nar.oxfordjournals.org/content/early/2012/03/08/nar.gks223.abstract" target="_blank" >http://nar.oxfordjournals.org/content/early/2012/03/08/nar.gks223.abstract</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1093/nar/gks223" target="_blank" >10.1093/nar/gks223</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Air2p is critical for the assembly and RNA-binding of the TRAMP complex and the KOW domain of Mtr4p is crucial for exosome activation
Popis výsledku v původním jazyce
Trf4/5p-Air1/2p-Mtr4p polyadenylation complex (TRAMP) is an essential component of nuclear RNA surveillance in yeast. It recognizes a variety of nuclear transcripts produced by all three RNA polymerases, adds short poly(A) tails to aberrant or unstable RNAs and activates the exosome for their degradation. Despite the advances in understanding the structural features of the isolated complex subunits or their fragments, the details of complex assembly, RNA recognition and exosome activation remain poorlyunderstood. Here we provide the first understanding of the RNA binding mode of the complex. We show that Air2p is an RNA-binding subunit of TRAMP. We identify the zinc knuckles (ZnK) 2, 3 and 4 as the RNA-binding domains, and reveal the essentiality of ZnK4 for TRAMP4 polyadenylation activity. Furthermore, we identify Air2p as the key component of TRAMP4 assembly providing bridging between Mtr4p and Trf4p.
Název v anglickém jazyce
Air2p is critical for the assembly and RNA-binding of the TRAMP complex and the KOW domain of Mtr4p is crucial for exosome activation
Popis výsledku anglicky
Trf4/5p-Air1/2p-Mtr4p polyadenylation complex (TRAMP) is an essential component of nuclear RNA surveillance in yeast. It recognizes a variety of nuclear transcripts produced by all three RNA polymerases, adds short poly(A) tails to aberrant or unstable RNAs and activates the exosome for their degradation. Despite the advances in understanding the structural features of the isolated complex subunits or their fragments, the details of complex assembly, RNA recognition and exosome activation remain poorlyunderstood. Here we provide the first understanding of the RNA binding mode of the complex. We show that Air2p is an RNA-binding subunit of TRAMP. We identify the zinc knuckles (ZnK) 2, 3 and 4 as the RNA-binding domains, and reveal the essentiality of ZnK4 for TRAMP4 polyadenylation activity. Furthermore, we identify Air2p as the key component of TRAMP4 assembly providing bridging between Mtr4p and Trf4p.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2012
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Nucleic Acids Research
ISSN
0305-1048
e-ISSN
—
Svazek periodika
40
Číslo periodika v rámci svazku
12
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
15
Strana od-do
5679-5693
Kód UT WoS článku
000305829000049
EID výsledku v databázi Scopus
—