Expansion of Microsatellites on Evolutionary Young Y Chromosome

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F13%3A00067677" target="_blank" >RIV/00216224:14740/13:00067677 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/68081707:_____/13:00392612

Výsledek na webu

<a href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3547029/" target="_blank" >http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3547029/</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0045519" target="_blank" >10.1371/journal.pone.0045519</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Expansion of Microsatellites on Evolutionary Young Y Chromosome

Popis výsledku v původním jazyce

Sex chromosomes are an ideal system to study processes connected with suppressed recombination. We found evidence of microsatellite expansion, on the relatively young Y chromosome of the dioecious plant sorrel (Rumex acetosa, XY1Y2 system), but no such expansion on the more ancient Y chromosomes of liverwort (Marchantia polymorpha) and human. The most expanding motifs were AC and AAC, which also showed periodicity of array length, indicating the importance of beginnings and ends of arrays. Our data indicate that abundance of microsatellites in genomes depends on the inherent expansion potential of specific motifs, which could be related to their stability and ability to adopt unusual DNA conformations. We also found that the abundance of microsatellites is higher in the neighborhood of transposable elements (TEs) suggesting that microsatellites are probably targets for TE insertions.

Název v anglickém jazyce

Expansion of Microsatellites on Evolutionary Young Y Chromosome

Popis výsledku anglicky

Sex chromosomes are an ideal system to study processes connected with suppressed recombination. We found evidence of microsatellite expansion, on the relatively young Y chromosome of the dioecious plant sorrel (Rumex acetosa, XY1Y2 system), but no such expansion on the more ancient Y chromosomes of liverwort (Marchantia polymorpha) and human. The most expanding motifs were AC and AAC, which also showed periodicity of array length, indicating the importance of beginnings and ends of arrays. Our data indicate that abundance of microsatellites in genomes depends on the inherent expansion potential of specific motifs, which could be related to their stability and ability to adopt unusual DNA conformations. We also found that the abundance of microsatellites is higher in the neighborhood of transposable elements (TEs) suggesting that microsatellites are probably targets for TE insertions.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2013

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

PLoS One

ISSN

1932-6203

e-ISSN

—

Svazek periodika

8

Číslo periodika v rámci svazku

1

Stát vydavatele periodika

US - Spojené státy americké

Počet stran výsledku

10

Strana od-do

—

Kód UT WoS článku

000313682700001

EID výsledku v databázi Scopus

—