Molecular Basis for Coordinating Transcription Termination with Noncoding RNA Degradation

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F14%3A00073613" target="_blank" >RIV/00216224:14740/14:00073613 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4186968/" target="_blank" >http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4186968/</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.molcel.2014.05.031" target="_blank" >10.1016/j.molcel.2014.05.031</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Molecular Basis for Coordinating Transcription Termination with Noncoding RNA Degradation

Popis výsledku v původním jazyce

The Nrd1-Nab3-Sen1 (NNS) complex is essential for controlling pervasive transcription and generating sn/snoRNAs in S. cerevisiae. The NNS complex terminates transcription of noncoding RNA genes and promotes exosome-dependent processing/degradation of thereleased transcripts. The Trf4-Air2-Mtr4 (TRAMP) complex polyadenylates NNS target RNAs and favors their degradation. NNS-dependent termination and degradation are coupled, but the mechanism underlying this coupling remains enigmatic. Here we provide structural and functional evidence demonstrating that the same domain of Nrd1p interacts with RNA polymerase II and Trf4p in a mutually exclusive manner, thus defining two alternative forms of the NNS complex, one involved in termination and the other in degradation. We show that the Nrd1-Trf4 interaction is required for optimal exosome activity in vivo and for the stimulation of polyadenylation of NNS targets by TRAMP in vitro.

Název v anglickém jazyce

Molecular Basis for Coordinating Transcription Termination with Noncoding RNA Degradation

Popis výsledku anglicky

The Nrd1-Nab3-Sen1 (NNS) complex is essential for controlling pervasive transcription and generating sn/snoRNAs in S. cerevisiae. The NNS complex terminates transcription of noncoding RNA genes and promotes exosome-dependent processing/degradation of thereleased transcripts. The Trf4-Air2-Mtr4 (TRAMP) complex polyadenylates NNS target RNAs and favors their degradation. NNS-dependent termination and degradation are coupled, but the mechanism underlying this coupling remains enigmatic. Here we provide structural and functional evidence demonstrating that the same domain of Nrd1p interacts with RNA polymerase II and Trf4p in a mutually exclusive manner, thus defining two alternative forms of the NNS complex, one involved in termination and the other in degradation. We show that the Nrd1-Trf4 interaction is required for optimal exosome activity in vivo and for the stimulation of polyadenylation of NNS targets by TRAMP in vitro.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

BO - Biofyzika

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2014

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Molecular Cell

ISSN

1097-2765

e-ISSN

—

Svazek periodika

55

Číslo periodika v rámci svazku

3

Stát vydavatele periodika

US - Spojené státy americké

Počet stran výsledku

15

Strana od-do

467-481

Kód UT WoS článku

000340646600012

EID výsledku v databázi Scopus

—