Distinct roles of non-canonical poly(A) polymerases in RNA metabolism
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F09%3A00036231" target="_blank" >RIV/00216224:14310/09:00036231 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Distinct roles of non-canonical poly(A) polymerases in RNA metabolism
Popis výsledku v původním jazyce
Trf4p and Trf5p are non canonical poly(A) polymerases and are part of the heteromeric protein complexes TRAMP4 and TRAMP5 that promote the degradation of aberrant and short lived RNA substrates by interacting with the nuclear exosome. To assess the levelof functional redundancy between the paralogous Trf4 and Trf5 proteins and to investigate the role of the Trf4 dependent polyadenylation in vivo, we used DNA microarrays to compare gene expression of the wild-type yeast strain of S. cerevisiae with either that of trf4delta or trf5delta mutant strains or the trf4delta mutant expressing the polyadenylation-defective Trf4(DADA) protein. We found little overlap between the sets of transcripts with altered expression in the trf4delta or the trf5delta mutants, suggesting that Trf4p and Trf5p target distinct groups of RNAs for degradation.
Název v anglickém jazyce
Distinct roles of non-canonical poly(A) polymerases in RNA metabolism
Popis výsledku anglicky
Trf4p and Trf5p are non canonical poly(A) polymerases and are part of the heteromeric protein complexes TRAMP4 and TRAMP5 that promote the degradation of aberrant and short lived RNA substrates by interacting with the nuclear exosome. To assess the levelof functional redundancy between the paralogous Trf4 and Trf5 proteins and to investigate the role of the Trf4 dependent polyadenylation in vivo, we used DNA microarrays to compare gene expression of the wild-type yeast strain of S. cerevisiae with either that of trf4delta or trf5delta mutant strains or the trf4delta mutant expressing the polyadenylation-defective Trf4(DADA) protein. We found little overlap between the sets of transcripts with altered expression in the trf4delta or the trf5delta mutants, suggesting that Trf4p and Trf5p target distinct groups of RNAs for degradation.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2009
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
PLoS Genetics
ISSN
1553-7390
e-ISSN
—
Svazek periodika
5
Číslo periodika v rámci svazku
7
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
17
Strana od-do
—
Kód UT WoS článku
000269219500032
EID výsledku v databázi Scopus
—