Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Quadruplex-forming sequences occupy discrete regions inside plant LTR retrotransposons

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F14%3A00074769" target="_blank" >RIV/00216224:14740/14:00074769 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/68081707:_____/14:00436687 RIV/68081707:_____/14:00440128

  • Výsledek na webu

    <a href="http://nar.oxfordjournals.org/content/early/2013/10/07/nar.gkt893" target="_blank" >http://nar.oxfordjournals.org/content/early/2013/10/07/nar.gkt893</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1093/nar/gkt893" target="_blank" >10.1093/nar/gkt893</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Quadruplex-forming sequences occupy discrete regions inside plant LTR retrotransposons

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Retrotransposons with long terminal repeats (LTR) form a significant proportion of eukaryotic genomes, especially in plants. They have gag and pol genes and several regulatory regions necessary for transcription and reverse transcription. We searched forpotential quadruplex-forming sequences (PQSs) and potential triplex forming sequences (PTSs) in 18 377 full-length LTR retrotransposons collected from 21 plant species. We found that PQSs were often located in LTRs, both upstream and downstream of promoters from which the whole retrotransposon is transcribed. Upstream-located guanine PQSs were dominant in the minus DNA strand, whereas downstream-located guanine PQSs prevailed in the plus strand, indicating their role both at transcriptional and post-transcriptional levels. Our circular dichroism spectroscopy measurements confirmed that these PQSs readily adopted guanine quadruplex structures - some of them were paralell-stranded, while others were anti-parallel-stranded.

  • Název v anglickém jazyce

    Quadruplex-forming sequences occupy discrete regions inside plant LTR retrotransposons

  • Popis výsledku anglicky

    Retrotransposons with long terminal repeats (LTR) form a significant proportion of eukaryotic genomes, especially in plants. They have gag and pol genes and several regulatory regions necessary for transcription and reverse transcription. We searched forpotential quadruplex-forming sequences (PQSs) and potential triplex forming sequences (PTSs) in 18 377 full-length LTR retrotransposons collected from 21 plant species. We found that PQSs were often located in LTRs, both upstream and downstream of promoters from which the whole retrotransposon is transcribed. Upstream-located guanine PQSs were dominant in the minus DNA strand, whereas downstream-located guanine PQSs prevailed in the plus strand, indicating their role both at transcriptional and post-transcriptional levels. Our circular dichroism spectroscopy measurements confirmed that these PQSs readily adopted guanine quadruplex structures - some of them were paralell-stranded, while others were anti-parallel-stranded.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    EB - Genetika a molekulární biologie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2014

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Nucleic Acids Research

  • ISSN

    0305-1048

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    42

  • Číslo periodika v rámci svazku

    2

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    11

  • Strana od-do

    968-978

  • Kód UT WoS článku

    000331138100030

  • EID výsledku v databázi Scopus