Simulations Suggest Possible Novel Membrane Pore Structure

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F14%3A00075124" target="_blank" >RIV/00216224:14740/14:00075124 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/la402727a" target="_blank" >http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/la402727a</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1021/la402727a" target="_blank" >10.1021/la402727a</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Simulations Suggest Possible Novel Membrane Pore Structure

Popis výsledku v původním jazyce

Amphiphilic proteins and peptides can induce the formation of stable and metastable pores in membranes. Using coarse-grained simulations, we have studied the factors that affect structure of peptide-stabilized pores. Our simulations are able to reproducethe formation of the well-known barrel-stave or toroidal pores, but in addition, we find evidence for a novel "double-belt" pore structure: in this structure the peptides that coat the membrane pore are oriented parallel to the membrane plane. To checkthe predictions of our coarse-grained model, we have performed more detailed simulations, using the MARTINI force field. These simulations show that the double-belt structure is stable up to at least the microsecond time scale.

Název v anglickém jazyce

Simulations Suggest Possible Novel Membrane Pore Structure

Popis výsledku anglicky

Amphiphilic proteins and peptides can induce the formation of stable and metastable pores in membranes. Using coarse-grained simulations, we have studied the factors that affect structure of peptide-stabilized pores. Our simulations are able to reproducethe formation of the well-known barrel-stave or toroidal pores, but in addition, we find evidence for a novel "double-belt" pore structure: in this structure the peptides that coat the membrane pore are oriented parallel to the membrane plane. To checkthe predictions of our coarse-grained model, we have performed more detailed simulations, using the MARTINI force field. These simulations show that the double-belt structure is stable up to at least the microsecond time scale.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/ED1.1.00%2F02.0068" target="_blank" >ED1.1.00/02.0068: CEITEC - central european institute of technology</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2014

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Langmuir

ISSN

0743-7463

e-ISSN

—

Svazek periodika

30

Číslo periodika v rámci svazku

5

Stát vydavatele periodika

US - Spojené státy americké

Počet stran výsledku

7

Strana od-do

1304-1310

Kód UT WoS článku

000331344000015

EID výsledku v databázi Scopus

—